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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

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270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

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100.1.#.a: Georgina Hernández Delgado

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Regulación transcripcional y post-transcripcional de la respuesta del frijol al estrés abiótico", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Georgina Hernández Delgado

245.1.0.a: Regulación transcripcional y post-transcripcional de la respuesta del frijol al estrés abiótico

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.0.c: 2010

264.#.1.c: 2010

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Genómica funcional de plantas leguminosas; Biología molecular y genética

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2010, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Las plantas requieren regular la expresión de cientos o miles de genes para asegurar su adecuado desarrollo, función y respuesta a cambios ambientales. Dicha regulación se da a niveles transcripcional y el post-transcripcional y requiere de la participación de diferentes factores de transcripción (TF) y de micro RNAs (miRNA). Los microRNAs son RNAs que no codifican para proteínas, de 18-24 nucleótidos de longitud que regulan la expresión génica, principalmente a través de inducir el corte, la degradación, de su mRNA blanco con el que tienen complementariedad de bases casi perfecta. En muchos caos, ambos tipos de reguladores globales actúan de manera conjunta, combinada, en redes regulatorias. La expresión de los genes de TF y precursores de los miRNAS se regula de manera específica ante respuestas a estreses ambientales tanto bióticos como abióticos e inciden en la modulación de la regulación de gran cantidad de genes (regulón) que participan en esa respuesta. _x000D_ Las plantas leguminosas interaccionan con bacterias Rhizobiaceae que fijan el nitrógeno (N) atmosférico. El frijol (Phaseolus vulgaris) es la leguminosa más importante para el consumo humano; sin embargo distintos estreses bióticos y abióticos comprometen su producción en América Latina y África. Los caracteres complejos como la fijación de N o la tolerancia a estrés abiótico requieren de múltiples genes que involucran diferentes mecanismos e intrincadas redes regulatorias por lo que se requieren investigarlos con enfoques genómicos integrales._x000D_ Este proyecto se basa en el conocimiento sobre génomica funcional de frijol generado por mi grupo en el Centro de Ciencias Genómicas. Hemos analizado el trancriptoma, metaboloma, perfil de expresión de TF y miRNAs de frijol en condiciones de estrés nutricional, en parte con financiamiento PAPIIT (IN211607). Ahora proponemos analizar la función de un TF de la familia TIFY de frijol (PvTIFY) y del miR172 y su blanco en frijol el TF: PvAP2, en el desarrollo de los nódulos y en la respuesta a estrés nutricional._x000D_ El TF PvTIFY (TC9869, DFCI / Bean Gene Index v.3.0) se induce (2 veces) tanto en raíces (no noduladas) como en nódulos de frijol en estrés por deficiencia de fósforo (P) y proponemos que tiene un papel regulador relevante en la respuesta a ese estrés. El PvTIFY es 44% homólogo al TF TIFY de Arabidopsis denominado AtJAZ que responde a ozono y a estrés salino y es un regulador negativo de miembros de la vía de señalización mediada por ácido jasmónico; no se ha reportado su papel en estrés por P. El PvTF pertenece al grupo II que codifica para proteínas que carecen de dominios para de unión a DNA y ejercen su papel de reguladores transcripcionales de manera indirecta. En este proyecto se plantea demostrar que en frijol el PvTIFY forma complejos con proteínas que directamente se unen a DNA y así ejerce su papel de regulador transcripcional. Si esto resulta así, se planteará un nuevo proyecto que investigue a los genes y mecanismos que este TF regula. _x000D_ Otro objetivo de este proyecto consiste en analizar el papel del miRNA conservado: miR172 que en Arabidopsis y en frijol tiene como blanco a un TF de la familia AP2. En Arabidopsis este miRNA y su blanco participan en procesos de desarrollo de la flor. Nosotros encontramos que el miR172 se expresa en nódulos y no en raíz u hojas de frijol, además se incrementa su expresión en nódulos en estrés por deficiencia de P y de hierro (Fe). Utilizaremos enfoques de genómica reversa para silenciar el miR172 o incrementar el transcrito de su blanco en plantas compuestas de frijol -con raíces transgénicas y parte aérea no transformada. A través de analizar el fenotipo –desarrollo, nodulación, transcripción de genes de respuesta a estrés- de las plantas compuestas “mutantes” creciendo en estrés nutricional definiremos la relevancia del miR172 y el AP2 en frijol. _x000D_ El descubrimiento de nuevos reguladores claves para la adaptación del frijol a estreses abióticos contribuirá a comprender mejor la señalización y la regulación molecular de este importante cultivo y podría contribuir, en el futuro, en obtener mejor germoplasma. _x000D_

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Regulación transcripcional y post-transcripcional de la respuesta del frijol al estrés abiótico

Centro de Ciencias Genómicas, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Regulación transcripcional y post-transcripcional de la respuesta del frijol al estrés abiótico", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Regulación transcripcional y post-transcripcional de la respuesta del frijol al estrés abiótico
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Georgina Hernández Delgado
Fecha
2010
Descripción
Las plantas requieren regular la expresión de cientos o miles de genes para asegurar su adecuado desarrollo, función y respuesta a cambios ambientales. Dicha regulación se da a niveles transcripcional y el post-transcripcional y requiere de la participación de diferentes factores de transcripción (TF) y de micro RNAs (miRNA). Los microRNAs son RNAs que no codifican para proteínas, de 18-24 nucleótidos de longitud que regulan la expresión génica, principalmente a través de inducir el corte, la degradación, de su mRNA blanco con el que tienen complementariedad de bases casi perfecta. En muchos caos, ambos tipos de reguladores globales actúan de manera conjunta, combinada, en redes regulatorias. La expresión de los genes de TF y precursores de los miRNAS se regula de manera específica ante respuestas a estreses ambientales tanto bióticos como abióticos e inciden en la modulación de la regulación de gran cantidad de genes (regulón) que participan en esa respuesta. _x000D_ Las plantas leguminosas interaccionan con bacterias Rhizobiaceae que fijan el nitrógeno (N) atmosférico. El frijol (Phaseolus vulgaris) es la leguminosa más importante para el consumo humano; sin embargo distintos estreses bióticos y abióticos comprometen su producción en América Latina y África. Los caracteres complejos como la fijación de N o la tolerancia a estrés abiótico requieren de múltiples genes que involucran diferentes mecanismos e intrincadas redes regulatorias por lo que se requieren investigarlos con enfoques genómicos integrales._x000D_ Este proyecto se basa en el conocimiento sobre génomica funcional de frijol generado por mi grupo en el Centro de Ciencias Genómicas. Hemos analizado el trancriptoma, metaboloma, perfil de expresión de TF y miRNAs de frijol en condiciones de estrés nutricional, en parte con financiamiento PAPIIT (IN211607). Ahora proponemos analizar la función de un TF de la familia TIFY de frijol (PvTIFY) y del miR172 y su blanco en frijol el TF: PvAP2, en el desarrollo de los nódulos y en la respuesta a estrés nutricional._x000D_ El TF PvTIFY (TC9869, DFCI / Bean Gene Index v.3.0) se induce (2 veces) tanto en raíces (no noduladas) como en nódulos de frijol en estrés por deficiencia de fósforo (P) y proponemos que tiene un papel regulador relevante en la respuesta a ese estrés. El PvTIFY es 44% homólogo al TF TIFY de Arabidopsis denominado AtJAZ que responde a ozono y a estrés salino y es un regulador negativo de miembros de la vía de señalización mediada por ácido jasmónico; no se ha reportado su papel en estrés por P. El PvTF pertenece al grupo II que codifica para proteínas que carecen de dominios para de unión a DNA y ejercen su papel de reguladores transcripcionales de manera indirecta. En este proyecto se plantea demostrar que en frijol el PvTIFY forma complejos con proteínas que directamente se unen a DNA y así ejerce su papel de regulador transcripcional. Si esto resulta así, se planteará un nuevo proyecto que investigue a los genes y mecanismos que este TF regula. _x000D_ Otro objetivo de este proyecto consiste en analizar el papel del miRNA conservado: miR172 que en Arabidopsis y en frijol tiene como blanco a un TF de la familia AP2. En Arabidopsis este miRNA y su blanco participan en procesos de desarrollo de la flor. Nosotros encontramos que el miR172 se expresa en nódulos y no en raíz u hojas de frijol, además se incrementa su expresión en nódulos en estrés por deficiencia de P y de hierro (Fe). Utilizaremos enfoques de genómica reversa para silenciar el miR172 o incrementar el transcrito de su blanco en plantas compuestas de frijol -con raíces transgénicas y parte aérea no transformada. A través de analizar el fenotipo –desarrollo, nodulación, transcripción de genes de respuesta a estrés- de las plantas compuestas “mutantes” creciendo en estrés nutricional definiremos la relevancia del miR172 y el AP2 en frijol. _x000D_ El descubrimiento de nuevos reguladores claves para la adaptación del frijol a estreses abióticos contribuirá a comprender mejor la señalización y la regulación molecular de este importante cultivo y podría contribuir, en el futuro, en obtener mejor germoplasma. _x000D_
Tema
Genómica funcional de plantas leguminosas; Biología molecular y genética
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN209710

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