dor_id: 1501144

506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

harvesting_group: ColeccionesUniversitarias

270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

883.#.#.a: Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

590.#.#.a: Administración central

883.#.#.1: http://www.ccud.unam.mx/

883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

850.#.#.a: Universidad Nacional Autónoma de México

856.4.0.u: http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN209511

100.1.#.a: Ernesto Pérez Rueda

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Reconstrucción de redes regulatorias en Arqueas", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Ernesto Pérez Rueda

245.1.0.a: Reconstrucción de redes regulatorias en Arqueas

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Instituto de Biotecnología, UNAM

264.#.0.c: 2011

264.#.1.c: 2011

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Bioinformática; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2011, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: La organismos del dominio Arquea representan una gran diversidad de hábitats, estilos de vida y divisiones celulares. El dominio representa una gran diversidad de organismos procariotes que se caracterizan por presentar una maquinaria basal similar a los eucariotes. Este tipo de organización hace que el estudio de su repertorio de factores de que se unen al DNA (FTs) y su organización en términos de redes regulatorias las hace particularmente interesantes. Sin embargo, sólo una pequeña fracción de sus reguladores y de sus regulones ha sido caracterizada experimentalmente. En este trabajo y basados en análisis publicados anteriormente y como continuación del proyecto financiado anteriormente (IN217508), se propone, la reconstrucción de la red regulatoria en tres organismos que consideramos modelo (Sulfolobus solfataricus, Pyrococcus abyssi y Nanoarchaeum equitans) y cuyos genomas están completamente secuenciados. Para dicho fin, se han considerado diversos elementos, tales como el repertorio de FTs (el cual ya se tiene identificado computacionalmente para 52 genomas), la predicción de operones, la recopilación de datos de expresión global, la identificación de ortologos, la utilización de herramientas computacionales, tales como string (una base de datos dedicada a la predicción de interacciones proteína-proteína), datos de microarreglos o de proteomas, así como la predicción de promotores y sus sitios de regulación. Finalmente, se propone la caracterización experimental de una familia de reguladores (Lrp) que incluyen a probables reguladores globales. En una primera etapa se propone la reconstrucción de la red en los organismos previamente mencionados, para que el enfoque sea posteriomente expandido hacia el resto de los arqueas completamente secuenciados y de los cuales tenemos información de sus reguladores transcripcionales. Adicionalmente, se propone que durante el proceso de reconstrucción, se identifiquen computacionalmente nuevos reguladores transcripcionales y que estos sean evaluados en términos de su abundancia para identificar eventos de expansión, contracción y invención de novo en los diversos genomas. El proyecto tiene como una de sus metas principales, más allá de la reconstrucción de la red regulatoria en estos organismos, la identificación de sus módulos funcionales y del papel funcional de los FTs identificados. La descripción funcional de la familia Lrp tiene como meta, la reconstrucción de una proteína reguladora “consenso”. En este sentido, en la segunda y tercera etapa del proyecto, se realizará la construcción de dicha proteína y se evaluará su paperl regulatorio en una cepa E. coli lrp-. Adicionalmente, se espera que las predicciones sean importantes para el diseño racional de experimentos dirigidos a corroborar las probables funciones, que serán depositadas en un servidor web del Instituto. Finalmente, se propone que durante la realización de este proyecto se graduen estudiantes de licenciatura y posgrado.

046.#.#.j: 2019-11-14 12:26:40.706

264.#.1.b: Dirección General de Asuntos del Personal Académico

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856.#.0.q: text/html

last_modified: 2019-11-22 00:00:00

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No entro en nada

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