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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Medicina y Ciencias de la Salud

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

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270.1.#.d: México

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100.1.#.a: María del Rocío Reyes Montes

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Obtención de marcadores scars a partir de patrones AFLP para la identificación de aislados de Coccidioides spp. procedentes de México y Argentina", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: María del Rocío Reyes Montes

245.1.0.a: Obtención de marcadores scars a partir de patrones AFLP para la identificación de aislados de Coccidioides spp. procedentes de México y Argentina

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264.#.1.c: 2009

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653.#.#.a: Micología molecular; Microbiología

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: La coccidioidomicosis o fiebre del Valle de San Joaquín es una enfermedad causada por hongos ascomicetos del género Coccidioides con dos especies descritas: Coccidioides immitis y Coccidioides posadasii. El establecimiento de estas dos especies se hizo con base en el gran polimorfismo del genoma del hongo, empleando microsatélites. La coccidioidomicosis es una enfermedad endémica en el suroeste de los Estados Unidos, norte de México, América Central y la zona árida precordillerana de América del Sur. La infección se produce por inhalación de artroconidios en los humanos y otros mamíferos. La enfermedad se inicia con un cuadro respiratorio agudo, en general benigna y cura espontáneamente, sin embargo, puede evolucionar hacia formas progresivas, que diseminan a los tejidos cutáneo, subcutáneo, visceral y óseo. En el diagnóstico de la coccidioidomicosis a la fecha hay numerosas pruebas de laboratorio para la identificación del patógeno, sin embargo, hasta el momento no existe una herramienta molecular estandarizada y consensuada que permita la identificación de las dos especies, puesto que las pruebas fenotípicas no permiten discriminar entre ambas especies aunque pequeñas diferencias en el crecimiento de las colonias se han observado sobre medios conteniendo sal. Tampoco se han observado diferencias en las formas clínicas de la enfermedad y entre los nichos ambientales de las dos especies, sin embargo, dado que las mismas se separan genética y geográficamente, es probable que difieran fenotípicamente. Con el advenimiento de la biología molecular, se han reportado varias sondas moleculares de Coccidioides, pero éstas tienen ciertos inconvenientes, ya sea intrínsecos (sensibilidad, especificidad, variabilidad genética) o extrínsecos (costo, tecnología utilizada, etc.), por lo que es indispensable disponer de marcadores moleculares evaluados y estandarizados que nos permitan la detección del patógeno, ya que en los países latinoamericanos como México y Argentina se carece de este tipo de herramientas para detectar o confirmar la identificación del hongo. Por lo que en este trabajo de plantea obtener marcadores moleculares específicos y sensibles como los tipo SCAR (Región Amplificada de una Secuencia Caracterizada) que permitan el desarrollo de ensayos rápidos y certeros para el diagnóstico e identificación de las especies de Coccidioides. Estos marcadores se elegirán de los patrones polimórficos generados por la técnica de AFLP (Polimorfismo en la Longitud de Fragmentos Amplificados) de aislados de México y Argentina con el propósito de seleccionar marcadores específicos de C. immitis y C. posadasii útiles para identificar aislados clínicos y de la naturaleza, una con la particularidad de revelar aislados autóctonos de cada país y la otra para identificar aislados del hongo de distintas procedencias. Para la obtención de los marcadores SCAR primero se elegirán sólo bandas compartidas por aislados de cada especie y país, a partir de los patrones polimórficos generados por AFLP, posteriormente éstas se clonarán y secuenciarán por los métodos moleculares tradicionales. Las secuencias se compararan con las secuencias de hongos depositadas en el GenBank, con el objetivo de descartar cualquier homología con otros hongos patógenos o no, para el humano. Con base en este análisis comparativo, se acotarán las secuencias iniciales de los fragmentos clonados eliminando las secuencias compartidas y se diseñarán dos pares de oligonucleótidos específicos para cada especie y país. Finalmente, se llevará a cabo la PCR con los oligonucleótidos diseñados y con aislados del hongo de las dos especies de distintas procedencias geográficas, así como hongos relacionados, para verificar su especificidad y sensibilidad.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Obtención de marcadores scars a partir de patrones AFLP para la identificación de aislados de Coccidioides spp. procedentes de México y Argentina

Facultad de Medicina, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Facultad de Medicina, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Obtención de marcadores scars a partir de patrones AFLP para la identificación de aislados de Coccidioides spp. procedentes de México y Argentina", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Obtención de marcadores scars a partir de patrones AFLP para la identificación de aislados de Coccidioides spp. procedentes de México y Argentina
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
María del Rocío Reyes Montes
Fecha
2009
Descripción
La coccidioidomicosis o fiebre del Valle de San Joaquín es una enfermedad causada por hongos ascomicetos del género Coccidioides con dos especies descritas: Coccidioides immitis y Coccidioides posadasii. El establecimiento de estas dos especies se hizo con base en el gran polimorfismo del genoma del hongo, empleando microsatélites. La coccidioidomicosis es una enfermedad endémica en el suroeste de los Estados Unidos, norte de México, América Central y la zona árida precordillerana de América del Sur. La infección se produce por inhalación de artroconidios en los humanos y otros mamíferos. La enfermedad se inicia con un cuadro respiratorio agudo, en general benigna y cura espontáneamente, sin embargo, puede evolucionar hacia formas progresivas, que diseminan a los tejidos cutáneo, subcutáneo, visceral y óseo. En el diagnóstico de la coccidioidomicosis a la fecha hay numerosas pruebas de laboratorio para la identificación del patógeno, sin embargo, hasta el momento no existe una herramienta molecular estandarizada y consensuada que permita la identificación de las dos especies, puesto que las pruebas fenotípicas no permiten discriminar entre ambas especies aunque pequeñas diferencias en el crecimiento de las colonias se han observado sobre medios conteniendo sal. Tampoco se han observado diferencias en las formas clínicas de la enfermedad y entre los nichos ambientales de las dos especies, sin embargo, dado que las mismas se separan genética y geográficamente, es probable que difieran fenotípicamente. Con el advenimiento de la biología molecular, se han reportado varias sondas moleculares de Coccidioides, pero éstas tienen ciertos inconvenientes, ya sea intrínsecos (sensibilidad, especificidad, variabilidad genética) o extrínsecos (costo, tecnología utilizada, etc.), por lo que es indispensable disponer de marcadores moleculares evaluados y estandarizados que nos permitan la detección del patógeno, ya que en los países latinoamericanos como México y Argentina se carece de este tipo de herramientas para detectar o confirmar la identificación del hongo. Por lo que en este trabajo de plantea obtener marcadores moleculares específicos y sensibles como los tipo SCAR (Región Amplificada de una Secuencia Caracterizada) que permitan el desarrollo de ensayos rápidos y certeros para el diagnóstico e identificación de las especies de Coccidioides. Estos marcadores se elegirán de los patrones polimórficos generados por la técnica de AFLP (Polimorfismo en la Longitud de Fragmentos Amplificados) de aislados de México y Argentina con el propósito de seleccionar marcadores específicos de C. immitis y C. posadasii útiles para identificar aislados clínicos y de la naturaleza, una con la particularidad de revelar aislados autóctonos de cada país y la otra para identificar aislados del hongo de distintas procedencias. Para la obtención de los marcadores SCAR primero se elegirán sólo bandas compartidas por aislados de cada especie y país, a partir de los patrones polimórficos generados por AFLP, posteriormente éstas se clonarán y secuenciarán por los métodos moleculares tradicionales. Las secuencias se compararan con las secuencias de hongos depositadas en el GenBank, con el objetivo de descartar cualquier homología con otros hongos patógenos o no, para el humano. Con base en este análisis comparativo, se acotarán las secuencias iniciales de los fragmentos clonados eliminando las secuencias compartidas y se diseñarán dos pares de oligonucleótidos específicos para cada especie y país. Finalmente, se llevará a cabo la PCR con los oligonucleótidos diseñados y con aislados del hongo de las dos especies de distintas procedencias geográficas, así como hongos relacionados, para verificar su especificidad y sensibilidad.
Tema
Micología molecular; Microbiología
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN215509

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