Modelación metabólica de cáncer y su integración con datos de proteoma
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
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506.#.#.a: Público
650.#.4.x: Biología y Química
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336.#.#.3: Registro de colección de proyectos
336.#.#.a: Registro de colección universitaria
351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales
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270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx
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100.1.#.a: Osbaldo Resendis Antonio
524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Modelación metabólica de cáncer y su integración con datos de proteoma", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.
720.#.#.a: Osbaldo Resendis Antonio
245.1.0.a: Modelación metabólica de cáncer y su integración con datos de proteoma
502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México
561.1.#.a: Centro de Ciencias Genómicas, UNAM
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264.#.1.c: 2009
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653.#.#.a: Biología de sistemas; Biología de sistemas
506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx
041.#.7.h: spa
500.#.#.a: El estudio de organismos biológicos desde una perspectiva de sistemas, denominada biología de sistemas, constituye una propuesta interesante para estudiar los mecanismos celulares desde un punto de vista global e integrativo. A pesar de que la definición de biología de sistemas aun no cuenta con un consenso, es reconocido que esta área se caracteriza por tener ciertas propiedades que la identifican y definen. Entre estas, se encuentra la integración del conocimiento biológico parcial (o reduccionista) de un organismo y su representación matemática con la finalidad de explorar los mecanismos fisiológicos de la célula en condiciones especificas. Pretender realizar esta descripción integral de una forma coherente y cuantitativa, imprime el reto de desarrollar formalismos matemáticos que permitan describir la actividad celular en forma comparable y compatible con la información generada a través de tecnología genómica. De esta forma la Biología de Sistemas propone una vertiente para discernir la lógica de la célula, es decir los mecanismos y principios por los cuales la célula regula sus procesos metabólicos y responde ante estímulos externos. Así por ejemplo, el desarrollo de tecnologías como los microarreglos y la proteomica han permitido explorar la actividad genética y enzimática para discernir los factores bioquímicos y genéticos que originan enfermedades como el cáncer y la obesidad. Sin embargo, aun cuando relevantes contribuciones se han reportado en la literatura, el desarrollo de modelos matemáticos para entender los mecanismo que originan las enfermedades en humanos esta aun en su etapa infantil. En México, el cáncer Cervico uterino es una de las principales causas de deceso en la población femenina y la necesidad de combatir esta desorden celular requiere de investigación interdisciplinaria que involucre las áreas clínicas y las ciencias formales para desarrollar modelos matemáticos auxiliares para entender su complejidad y propicien el diseño racional de fármacos. En este contexto, este proyecto de investigación se enfoca a desarrollar la biología de sistemas en células cancerigenas. Concretamente el objetivo es construir un modelo matemático, que integre vías metabólicas con evidencia en la participación del cáncer y que constituya de una plataforma in silico para entender los mecanismos complejos de esta enfermedad en conexión cercana con datos generados de proteomica. Con la finalidad de concretar este objetivo, este proyecto se integra de tres fases. La primera fase consistirá en la reconstrucción de una red biológica que integre las principales vías metabólicas y de regulación con clara evidencia en la participación directa del cáncer. La segunda fase consistirá en el desarrollo de métodos matemáticos propios para estudiar las capacidades fenotipicas de esa red construida. Finalmente la tercera fase consistirá en reafinar el modelo a través de comparar la datos experimentales realizados de proteomica para células cancerigenas cultivadas in vitro y las predicciones obtenidas del modelo in silico. La reconstrucción y modelación del metabolismo en células cancerigenas es una propuesta innovadora e implica el desarrollo de esquemas teórico capaces de integrar los mecanismos metabólicos fundamentales que conlleva esta enfermedad. Además de la modelación in silico, este proyecto contempla la verificación experimental de las predicciones teóricas generadas por el modelo matemático. Particularmente es nuestro objetivo generar y obtener mediciones de proteoma para células cancerigenas. Esta línea de investigación es novedosa y original en la comunidad científica, por lo que tendrá un relevante impacto en la modelación del cáncer desde la biología de sistemas. Particularmente, soy optimista de que esta plataforma matemática contribuirá a entender los mecanismo bioquímicos por los cuales el fenotipo del cáncer se origina, y al mismo tiempo desarrollar hipótesis, entender su fisiología y potencialmente contribuir en el diseño de fármacos.
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last_modified: 2019-11-22 00:00:00
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Centro de Ciencias Genómicas, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Modelación metabólica de cáncer y su integración con datos de proteoma", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.