Identificación de transcritos regulados por microRNAs en respuesta a déficit hídrico en Phaseolus vulgaris
Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
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506.#.#.a: Público
650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias
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336.#.#.3: Registro de colección de proyectos
336.#.#.a: Registro de colección universitaria
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100.1.#.a: José Luis Reyes Taboada
524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Identificación de transcritos regulados por microRNAs en respuesta a déficit hídrico en Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.
720.#.#.a: José Luis Reyes Taboada
245.1.0.a: Identificación de transcritos regulados por microRNAs en respuesta a déficit hídrico en Phaseolus vulgaris
502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México
561.1.#.a: Instituto de Biotecnología, UNAM
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264.#.1.c: 2012
307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491
653.#.#.a: Rnas pequeños en plantas; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica
506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2012, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx
041.#.7.h: spa
500.#.#.a: Los microRNAs (miRNAs) son moléculas de RNA de 20-24 nucleótidos, que actúan como factores reguladores de la expresión genética tanto en animales como en plantas (Axtell et al., 2011). El complejo multiproteico de silenciamiento inducido por RNA (RISC) utiliza a los miRNAs para reconocer por complementariedad de bases a un transcrito blanco e inhibir su expresión. Este mecanismo es utilizado por las plantas para regular distintos procesos del desarrollo y de respuesta a fitohormonas (Kidner and Martienssen, 2005). En respuesta a estrés por falta de agua, se ha identificado la inducción de miR159 por sequía o por ácido abscísico (ABA) durante la germinación (Reyes and Chua, 2007), mientras que miR169 se inhibe durante sequía en plantas adultas de A. thaliana (Li et al., 2008). Por otro lado, mediante el uso de estrategias globales como secuenciación masiva y microarreglos se han descrito miRNAs cuyos niveles cambian durante tratamientos de déficit hídrico y otros tipos de estrés en distintas especies (revisado en Covarrubias and Reyes, 2010). A pesar de estos avances, la identificación de los transcritos regulados por estos miRNAs se ha limitado en la mayoría de los casos a aquellos descritos en A. thaliana y su papel en condiciones de estrés no se ha explorado ampliamente. El papel de los miRNAs sólo puede ser entendido si conocemos los mensajeros que son regulados y en consecuencia los procesos celulares que se ven afectados. La identificación de dichos transcritos blanco es la parte medular de esta propuesta y el objetivo principal de nuestros estudios en un futuro próximo._x000D_ Utilizamos Phaseolus vulgaris como modelo para estudiar la función de los miRNAs en respuesta a diferentes estímulos ambientales por ser una planta de interés agronómico. A la fecha, hemos identificado nuevos miRNAs en frijol presentes en condiciones de estrés e iniciado la caracterización de varios de ellos (Arenas-Huertero et al., 2009) y más recientemente hemos continuado su identificación de forma global mediante el uso de estrategias de secuenciación masiva (tesis de licenciatura en Ciencias Genómicas de Minerva Trejo y resultados no publicados). Tomando este conocimiento como base, en el presente proyecto trataremos de extender nuestro entendimiento de la función de los miRNAs enfocándonos en la identificación de sus mRNAs blanco. Para ello tomaremos dos estrategias complementarias: por un lado continuaremos con el estudio de algunos miRNAs nuevos que se inducen por déficit hídrico: miR2118, miR2199, miR2199 y miR1514a, así como otros de reciente identificación por secuenciación masiva. Por otro lado seguiremos con un enfoque global para caracterizar la población de transcritos que son blanco de regulación por miRNAs. Para ello, utilizaremos la identificación por secuenciación masiva de transcritos que fueron cortados por la acción de miRNAs. Este análisis ya ha iniciado con resultados preliminares muy alentadores. Cabe mencionar que una de nuestras limitaciones es la falta de la secuencia completa del genoma de P. vulgaris, aunque avances recientes en otros grupos de trabajo indican que contaremos con esta información durante el desarrollo de este proyecto. La caracterización de nuevos miRNAs en frijol, junto con el análisis de los mensajeros regulados por los mismos, nos dará una idea de la relevancia biológica de este mecanismo de regulación para la respuesta a estrés, así como de la diversidad de procesos afectados por los miRNAs de plantas en general.
046.#.#.j: 2019-11-14 12:26:40.706
264.#.1.b: Dirección General de Asuntos del Personal Académico
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last_modified: 2019-11-22 00:00:00
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Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Identificación de transcritos regulados por microRNAs en respuesta a déficit hídrico en Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.