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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

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100.1.#.a: Luis Enrique Eguiarte Fruns

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Genética de poblaciones molecular y filogeografía de plantas mexicanas", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Luis Enrique Eguiarte Fruns

245.1.0.a: Genética de poblaciones molecular y filogeografía de plantas mexicanas

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Instituto de Ecología, UNAM

264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

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653.#.#.a: Genética de poblaciones y evolución molecular; Ecología y evolución

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: En este proyecto pretendemos analizar de manera comparada la genética de poblaciones molecular y la filogeografía de Abies y Agave en Mexico, usando diversos marcadores moleculares, en particular secuencias de ADN nuclear, de cloroplasto y de mitocondria y comparar estos patrones con otros estudios similares con otras plantas. Los nuevos avances genómicos en estos y en grupos de plantas cercanos nos permitirán obtener una buena cantidad de genes nucleares, microsatélites nucleares y una buena resolución de sus haplotipos y secuencias de cloroplasto y mitocondria. Creemos que el entendimiento fino de la evolución de estos géneros nos puede ayudar a entender los mecanismos que generan y mantienen la diversidad que se encuentra en México. Abies es un género de distribución mundial y actualmente reconocemos 8 taxa para México (Abies concolor, A. durangensis, A. durangensis var. coahuilensis, A. flinckii, A. guatemalensis, A. hickelii, A. religiosa y A. vejari). Hemos estudiado con cuidado su genética de poblaciones con isoezimas y recientemente publicamos el análisis de su genética de poblaciones y filogeografia con cloroplasto y mitocondria para las cuatro especies sureñas, pero nos falta el estudio de las poblaciones del norte. Tenemos tres genes de cloroplasto secuenciados para todas las especies de Abies mexicanas y una buena muestra del resto de las especies en el mundo, y nos gustaría ampliar esta muestra para tener siete genes de cloroplasto y varios mitocondriales. Adicionalmente, la obtención de secuencias de genes nucleares de copia única y microsatélites nos permitiría confirmar o falsificar las hipótesis generadas con los marcadores uniparentales, y podremos hacer inferencias filgoeográficas, evolutivas y paleoclimáticas para México. Iniciamos una colaboración con un grupo en España con los que vamos a desarrollar los primers para obtener las secuencias de unos 100 genes para una muestra (uno o dos individuos por especie), para luego elegir unos 10 genes interesantes y secuenciar varios individuos de muchas poblaciones. Por otra parte, Agave es un género muy grande, uno de los más grandes de nuestra flora, con unas 170 especie descritas. Hemos avanzado en el estudio de su filogenia y reloj molecular, pero queda claro que es un conjunto de especies muy recientes, con poca diferenciación a nivel cloroplasto y posiblemente flujo génico e introgresión entre ellas, lo que representa un problema en este tipo de estudios. Recientemente, varios proyecto genómicos han obtenido transcriptomas parciales, y a partir de ellos podemos diseñar primers específicos para obtener y analizar genes de copia única para realizar estudios de genética de poblaciones. Por otro lado, vamos a montar microsatélites en Agave para obtener una mejor resolución en la genética de poblaciones y para poder hacer estudios detallados de flujo génico y clonalidad. Dado que el género Agave es demasiado grande para estudiarlo en su totalidad, hemos decidido concretarnos en esta etapa en dos especies, A. lechuguilla y A. striata, que son filogenéticamente cercanas, que tienen distribución simpátrica en el desierto de Chihuahua y que hemos estudiado con cuidado con otros marcadores genéticos. Indudablemente este es un proyecto ambicioso, pero consideramos que se puede hacer, ya que tenemos la infraestructura física para realizarlo y las colectas y el conocimiento para llevarlo a cabo. Básicamente, todos los recursos que se solicitan se usarán en el trabajo de laboratorio y para pagar la secuenciación. Creemos que sólo con proyectos de esta envergadura se puede competir con los laboratorios internacionales que están a la vanguardia del campo.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Genética de poblaciones molecular y filogeografía de plantas mexicanas

Instituto de Ecología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Ecología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Genética de poblaciones molecular y filogeografía de plantas mexicanas", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Genética de poblaciones molecular y filogeografía de plantas mexicanas
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Luis Enrique Eguiarte Fruns
Fecha
2009
Descripción
En este proyecto pretendemos analizar de manera comparada la genética de poblaciones molecular y la filogeografía de Abies y Agave en Mexico, usando diversos marcadores moleculares, en particular secuencias de ADN nuclear, de cloroplasto y de mitocondria y comparar estos patrones con otros estudios similares con otras plantas. Los nuevos avances genómicos en estos y en grupos de plantas cercanos nos permitirán obtener una buena cantidad de genes nucleares, microsatélites nucleares y una buena resolución de sus haplotipos y secuencias de cloroplasto y mitocondria. Creemos que el entendimiento fino de la evolución de estos géneros nos puede ayudar a entender los mecanismos que generan y mantienen la diversidad que se encuentra en México. Abies es un género de distribución mundial y actualmente reconocemos 8 taxa para México (Abies concolor, A. durangensis, A. durangensis var. coahuilensis, A. flinckii, A. guatemalensis, A. hickelii, A. religiosa y A. vejari). Hemos estudiado con cuidado su genética de poblaciones con isoezimas y recientemente publicamos el análisis de su genética de poblaciones y filogeografia con cloroplasto y mitocondria para las cuatro especies sureñas, pero nos falta el estudio de las poblaciones del norte. Tenemos tres genes de cloroplasto secuenciados para todas las especies de Abies mexicanas y una buena muestra del resto de las especies en el mundo, y nos gustaría ampliar esta muestra para tener siete genes de cloroplasto y varios mitocondriales. Adicionalmente, la obtención de secuencias de genes nucleares de copia única y microsatélites nos permitiría confirmar o falsificar las hipótesis generadas con los marcadores uniparentales, y podremos hacer inferencias filgoeográficas, evolutivas y paleoclimáticas para México. Iniciamos una colaboración con un grupo en España con los que vamos a desarrollar los primers para obtener las secuencias de unos 100 genes para una muestra (uno o dos individuos por especie), para luego elegir unos 10 genes interesantes y secuenciar varios individuos de muchas poblaciones. Por otra parte, Agave es un género muy grande, uno de los más grandes de nuestra flora, con unas 170 especie descritas. Hemos avanzado en el estudio de su filogenia y reloj molecular, pero queda claro que es un conjunto de especies muy recientes, con poca diferenciación a nivel cloroplasto y posiblemente flujo génico e introgresión entre ellas, lo que representa un problema en este tipo de estudios. Recientemente, varios proyecto genómicos han obtenido transcriptomas parciales, y a partir de ellos podemos diseñar primers específicos para obtener y analizar genes de copia única para realizar estudios de genética de poblaciones. Por otro lado, vamos a montar microsatélites en Agave para obtener una mejor resolución en la genética de poblaciones y para poder hacer estudios detallados de flujo génico y clonalidad. Dado que el género Agave es demasiado grande para estudiarlo en su totalidad, hemos decidido concretarnos en esta etapa en dos especies, A. lechuguilla y A. striata, que son filogenéticamente cercanas, que tienen distribución simpátrica en el desierto de Chihuahua y que hemos estudiado con cuidado con otros marcadores genéticos. Indudablemente este es un proyecto ambicioso, pero consideramos que se puede hacer, ya que tenemos la infraestructura física para realizarlo y las colectas y el conocimiento para llevarlo a cabo. Básicamente, todos los recursos que se solicitan se usarán en el trabajo de laboratorio y para pagar la secuenciación. Creemos que sólo con proyectos de esta envergadura se puede competir con los laboratorios internacionales que están a la vanguardia del campo.
Tema
Genética de poblaciones y evolución molecular; Ecología y evolución
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN224309

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