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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

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351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

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270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

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100.1.#.a: Valeria Francisca Eugenia Leopoldina de María de Guadalupe Souza Saldívar

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico mexicano utilizando metagenómica", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Valeria Francisca Eugenia Leopoldina de María de Guadalupe Souza Saldívar

245.1.0.a: Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico mexicano utilizando metagenómica

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.1.c: 2009

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653.#.#.a: Ecología microbiana y metagenómica; Microbiología

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Nuestro interés se centra en evaluar la efectividad de diversos marcadores genéticos de enfermedades diarreicas en los metagenomas de las aguas de algunas playas del Pacífico Mexicano, basados en la premisa de que éstas bacterias de importancia médica permanecen viables por mucho tiempo en ambientes naturales manteniendo su potencial infectivo. Sabemos que el mar es receptor de los deshechos provenientes de los drenajes, de las industrias y de las actividades recreativas y deportivas que se dan en las playas. Debido a esto, la presencia de organismos patógenos dañinos para el hombre en las playas ya ha sido causa de clausura de éstas alrededor del mundo, generando pérdidas económicas enormes en el área turística, por lo que el monitoreo de comunidades microbianas naturales y de bacterias patógenas causantes de enfermedades gastrointestinales presentes en las playas y en el océano tiene una gran importancia a nivel económico y de salud pública. A pesar de la importancia de la contaminación de los mares por desechos humanos, los métodos de detección de patógenos son poco sensibles e inespecíficos, aportando poca información sobre la composición de las comunidades microbianas presentes y la presencia de genes específicos asociados a patología gastrointestinal de origen infeccioso. Durante varios años hemos estudiado el comportamiento evolutivo de diversos marcadores en E. coli relacionados con la patogénesis de las diarreas (Apoyados por Pappit desde 2000) y tenemos muy bien detectados genes similares en varios enteropatógenos; también hemos trabajado bioinformaticamente la búsqueda de marcadores genómicos independientes a patogenicidad que nos indican la presencia/ausencia de especies particulares de bacterias. En este momento contamos con la oportunidad única de utilizar la base de datos de 21 metagenómas del Pacífico Mexicano que está siendo generado por Craig Venter en nuestros océanos (bajo mi permiso de colecta) para poder buscar estos genes asociados a las diarreas en las playas mexicanas (6 sitios), por análisis bioinformático en la base de datos y por PCR dirigido, podemos comparar su prevalencia con el océano abierto (15 sitios) generando así la primera prueba en campo del diseño del microarreglo en el cual hemos trabajado por varios años en mi laboratorio y que permitirá una detección confiable y oportuna de la posibilidad de infección u intoxicación asociada no solo a las playas sino a cualquier otra fuente de agua.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico mexicano utilizando metagenómica

Instituto de Ecología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Ecología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico mexicano utilizando metagenómica", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico mexicano utilizando metagenómica
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Valeria Francisca Eugenia Leopoldina de María de Guadalupe Souza Saldívar
Fecha
2009
Descripción
Nuestro interés se centra en evaluar la efectividad de diversos marcadores genéticos de enfermedades diarreicas en los metagenomas de las aguas de algunas playas del Pacífico Mexicano, basados en la premisa de que éstas bacterias de importancia médica permanecen viables por mucho tiempo en ambientes naturales manteniendo su potencial infectivo. Sabemos que el mar es receptor de los deshechos provenientes de los drenajes, de las industrias y de las actividades recreativas y deportivas que se dan en las playas. Debido a esto, la presencia de organismos patógenos dañinos para el hombre en las playas ya ha sido causa de clausura de éstas alrededor del mundo, generando pérdidas económicas enormes en el área turística, por lo que el monitoreo de comunidades microbianas naturales y de bacterias patógenas causantes de enfermedades gastrointestinales presentes en las playas y en el océano tiene una gran importancia a nivel económico y de salud pública. A pesar de la importancia de la contaminación de los mares por desechos humanos, los métodos de detección de patógenos son poco sensibles e inespecíficos, aportando poca información sobre la composición de las comunidades microbianas presentes y la presencia de genes específicos asociados a patología gastrointestinal de origen infeccioso. Durante varios años hemos estudiado el comportamiento evolutivo de diversos marcadores en E. coli relacionados con la patogénesis de las diarreas (Apoyados por Pappit desde 2000) y tenemos muy bien detectados genes similares en varios enteropatógenos; también hemos trabajado bioinformaticamente la búsqueda de marcadores genómicos independientes a patogenicidad que nos indican la presencia/ausencia de especies particulares de bacterias. En este momento contamos con la oportunidad única de utilizar la base de datos de 21 metagenómas del Pacífico Mexicano que está siendo generado por Craig Venter en nuestros océanos (bajo mi permiso de colecta) para poder buscar estos genes asociados a las diarreas en las playas mexicanas (6 sitios), por análisis bioinformático en la base de datos y por PCR dirigido, podemos comparar su prevalencia con el océano abierto (15 sitios) generando así la primera prueba en campo del diseño del microarreglo en el cual hemos trabajado por varios años en mi laboratorio y que permitirá una detección confiable y oportuna de la posibilidad de infección u intoxicación asociada no solo a las playas sino a cualquier otra fuente de agua.
Tema
Ecología microbiana y metagenómica; Microbiología
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN219109

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