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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

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270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

883.#.#.a: Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

590.#.#.a: Administración central

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883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

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100.1.#.a: Claudia Díaz Camino

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Estudio genómico funcional de la familia génica de nodulinas de Glycine max IPR003387, estructuralmente relacionada a la familia de la nodulina 30 de Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Claudia Díaz Camino

245.1.0.a: Estudio genómico funcional de la familia génica de nodulinas de Glycine max IPR003387, estructuralmente relacionada a la familia de la nodulina 30 de Phaseolus vulgaris

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Genómica funcional; Biología molecular y genética

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Desde un punto de vista fundamental, la estrecha asociación que existe entre plantas leguminosas y Rhizobia provee de un excelente modelo de estudio para el análisis de la compleja señalización molecular que inicia y controla la simbiosis. Por otro lado, el exámen de la ontogenia del nódulo simbiótico, así como la determinación de la función de los genes implicados en este proceso, contribuyen de manera importante al entendimiento de la diferenciación celular, así como a la integración de la maquinaria responsable del control del ciclo celular, mecanismos que son aún desconocidos en plantas. Las nodulinas son proteínas codificadas por el genoma de la planta que se inducen durante la formación y el establecimiento del nódulo simbiótico. Estas proteínas no se producen en raíces no infectadas, bacteroides, o en Rhizobia de vida libre, y se ha propuesto que se encuentran involucradas en la formación, el desarrollo, mantenimiento y metabolismo de este nueva órgano (van Kammen, 1984). En esta propuesta experimental estamos interesados en elucidar la función biológica de la familia de nodulinas tardías tipo A (IPR003387) de soya (Glycine max), originalmente descrita por Jacobs et al en 1987, que está estructuralmente relacionada a la familia Nod30 de Phaseolus vulgaris (o fríjol común) (Campos, et al. 1995). En soya, esta familia génica se encuentra constituída por 7 miembros; Nod23, 26B, C51, E27, 26A, 27 y 20 (http://www.ebi.ac.uk/interpro/), que, al igual que en fríjol, se distinguen por contener dos dominios, cada uno con dos regiones Cys-X7-Cys, espaciadas de manera semejante a los dominios proteicos conocidos como “dedos de zinc”. Estudios previos indican que los transcritos de los genes que conforman a esta familia se localizan diferencialmente dentro del nódulo (Jacobs et al, 1987). Previamente en nuestro laboratorio se encontró que la alteración de la expresión de la familia multigénica Nod30 de fríjol común tiene un profundo efecto en la modulación del ciclo celular. Sin embargo, la función biológica que los define no ha sido aún determinada, ya que el silenciamiento específico de dichos genes resulta sumamente complicado dada la alta identidad de la familia génica. Por lo anterior, hemos optado por silenciar de manera específica a cada uno de los genes que integran a la familia de nodulinas tardías tipo A de soya, ya que la identidad entre éstos se restringe a regiones aminoacídicas discretas. Para lograr este propósito, utilizaremos el sistema de silenciamiento viral (VIGS) desarrollado en el laboratorio del Dr. Said Ghabrial, de la Universidad de Kentucky, con quien hemos establecido una estrecha colaboración académica. El Dr. Ghabrial cuenta con una colección de vectores de expresión recombinante del virus del moteo clorótico de fríjol (BMPV), que ha resultado de suma utilidad para el estudio de la función de diversos genes en soya. En paralelo, generaremos distintas construcciones de silenciamiento, e induciremos la formación de raíces transgénicas con Agrobacterium rhizogenes, de acuerdo a la técnica originalmente descrita por el grupo del Dr. Paul Gresshof, en Queensland Australia, y que ha sido mejorada en nuestro laboratorio (Estrada-Navarrete et al, 2006).

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Estudio genómico funcional de la familia génica de nodulinas de Glycine max IPR003387, estructuralmente relacionada a la familia de la nodulina 30 de Phaseolus vulgaris

Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biotecnología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Estudio genómico funcional de la familia génica de nodulinas de Glycine max IPR003387, estructuralmente relacionada a la familia de la nodulina 30 de Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Estudio genómico funcional de la familia génica de nodulinas de Glycine max IPR003387, estructuralmente relacionada a la familia de la nodulina 30 de Phaseolus vulgaris
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Claudia Díaz Camino
Fecha
2009
Descripción
Desde un punto de vista fundamental, la estrecha asociación que existe entre plantas leguminosas y Rhizobia provee de un excelente modelo de estudio para el análisis de la compleja señalización molecular que inicia y controla la simbiosis. Por otro lado, el exámen de la ontogenia del nódulo simbiótico, así como la determinación de la función de los genes implicados en este proceso, contribuyen de manera importante al entendimiento de la diferenciación celular, así como a la integración de la maquinaria responsable del control del ciclo celular, mecanismos que son aún desconocidos en plantas. Las nodulinas son proteínas codificadas por el genoma de la planta que se inducen durante la formación y el establecimiento del nódulo simbiótico. Estas proteínas no se producen en raíces no infectadas, bacteroides, o en Rhizobia de vida libre, y se ha propuesto que se encuentran involucradas en la formación, el desarrollo, mantenimiento y metabolismo de este nueva órgano (van Kammen, 1984). En esta propuesta experimental estamos interesados en elucidar la función biológica de la familia de nodulinas tardías tipo A (IPR003387) de soya (Glycine max), originalmente descrita por Jacobs et al en 1987, que está estructuralmente relacionada a la familia Nod30 de Phaseolus vulgaris (o fríjol común) (Campos, et al. 1995). En soya, esta familia génica se encuentra constituída por 7 miembros; Nod23, 26B, C51, E27, 26A, 27 y 20 (http://www.ebi.ac.uk/interpro/), que, al igual que en fríjol, se distinguen por contener dos dominios, cada uno con dos regiones Cys-X7-Cys, espaciadas de manera semejante a los dominios proteicos conocidos como “dedos de zinc”. Estudios previos indican que los transcritos de los genes que conforman a esta familia se localizan diferencialmente dentro del nódulo (Jacobs et al, 1987). Previamente en nuestro laboratorio se encontró que la alteración de la expresión de la familia multigénica Nod30 de fríjol común tiene un profundo efecto en la modulación del ciclo celular. Sin embargo, la función biológica que los define no ha sido aún determinada, ya que el silenciamiento específico de dichos genes resulta sumamente complicado dada la alta identidad de la familia génica. Por lo anterior, hemos optado por silenciar de manera específica a cada uno de los genes que integran a la familia de nodulinas tardías tipo A de soya, ya que la identidad entre éstos se restringe a regiones aminoacídicas discretas. Para lograr este propósito, utilizaremos el sistema de silenciamiento viral (VIGS) desarrollado en el laboratorio del Dr. Said Ghabrial, de la Universidad de Kentucky, con quien hemos establecido una estrecha colaboración académica. El Dr. Ghabrial cuenta con una colección de vectores de expresión recombinante del virus del moteo clorótico de fríjol (BMPV), que ha resultado de suma utilidad para el estudio de la función de diversos genes en soya. En paralelo, generaremos distintas construcciones de silenciamiento, e induciremos la formación de raíces transgénicas con Agrobacterium rhizogenes, de acuerdo a la técnica originalmente descrita por el grupo del Dr. Paul Gresshof, en Queensland Australia, y que ha sido mejorada en nuestro laboratorio (Estrada-Navarrete et al, 2006).
Tema
Genómica funcional; Biología molecular y genética
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN202009

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