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100.1.#.a: Rosa María Gutiérrez Ríos

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720.#.#.a: Rosa María Gutiérrez Ríos

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506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2012, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: En los últimos años, la aplicación de la teoría de redes al estudio de los sistemas biológicos, ha demostrado que éstos comparten propiedades topológicas que han permitido empezar a conocer los mecanismos generales que han sido seleccionados a lo largo de la historia evolutiva. Una de estas propiedades es la modularidad, que nos permite descomponer a la red en entidades cohesivas y menos conectadas con el resto de la red. La importancia de esta propiedad y su asociación con posibles roles fisiológicos en los sistemas biológicos son de trascendencia para redefinir el concepto de función a partir de la relación módulo-función. De particular relevancia resulta la aplicación de este tipo de estudios a redes de regulación transcripcional, que son las responsables de controlar la expresión de genes frente a una condición particular. A pesar de que se han hecho análisis topológicos de las redes de diferentes organismos modelo, Bacillus subtilis ha estado ausente en ellos. Dado que es la bacteria Gram-positiva mejor caracterizada y el organismo modelo de este grupo de bacterias, nuestro proyecto de investigación está enfocado en entender la organización de su red de regulación transcripcional con el objetivo de facilitar la comprensión de los procesos fisiológicos de B. subtilis en respuesta a diversas condiciones de crecimiento y señales medio-ambientales. . _x000D_ _x000D_ Así, esta propuesta toma como modelo nuestro trabajo en E. coli sobre el análisis topológico de su red de regulación de la red que considera la relación topológica que existe entre los FTs de la red de regulación transcripcional, donde factores sigma no son evaluados como parte de esta red. El trabajo de mi ex alumna de licenciatura Alejandra Manjares sobre la red de regulación de B. subtilis, en donde a diferencia del trabajo en E. coli, tomamos un enfoque intermedio que considera a todos los FTs, factores sigma excepto a al factor SigmaA (se explica mas ampliamente en el protocolo), con la cual determinamos que esta subred es libre de escala y que sigue un comportamiento de tipo jerárquico modular. Este estudio, nos permitió encontrar módulos con elementos relacionados con funciones biológicas homogéneas en donde algunos de ellos se encuentra ligados entre sí a través de FTs, que definimos como intermodulares debido a que conectan a uno a mas módulos. A esto FTs intermodulares proponemos inactivarlos con la idea de encontrar la influencia que tienen en la estructura de la red y tratar entender que alternativas toma la bacteria ante la ausencia de ellos. El análisis de los efectos sobre la red se realizará a través de experimentos de microarreglos sobre los cuales se calcularán las modificaciones en las propiedades estadísticas y la reorganización que los módulos presenten. _x000D_

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Estudio comparativo de la red de regulación trascripcional de Bacillus subtilis, como producto de su análisis en distintas condiciones expedimentales

Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biotecnología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Estudio comparativo de la red de regulación trascripcional de Bacillus subtilis, como producto de su análisis en distintas condiciones expedimentales", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Estudio comparativo de la red de regulación trascripcional de Bacillus subtilis, como producto de su análisis en distintas condiciones expedimentales
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Rosa María Gutiérrez Ríos
Fecha
2012
Descripción
En los últimos años, la aplicación de la teoría de redes al estudio de los sistemas biológicos, ha demostrado que éstos comparten propiedades topológicas que han permitido empezar a conocer los mecanismos generales que han sido seleccionados a lo largo de la historia evolutiva. Una de estas propiedades es la modularidad, que nos permite descomponer a la red en entidades cohesivas y menos conectadas con el resto de la red. La importancia de esta propiedad y su asociación con posibles roles fisiológicos en los sistemas biológicos son de trascendencia para redefinir el concepto de función a partir de la relación módulo-función. De particular relevancia resulta la aplicación de este tipo de estudios a redes de regulación transcripcional, que son las responsables de controlar la expresión de genes frente a una condición particular. A pesar de que se han hecho análisis topológicos de las redes de diferentes organismos modelo, Bacillus subtilis ha estado ausente en ellos. Dado que es la bacteria Gram-positiva mejor caracterizada y el organismo modelo de este grupo de bacterias, nuestro proyecto de investigación está enfocado en entender la organización de su red de regulación transcripcional con el objetivo de facilitar la comprensión de los procesos fisiológicos de B. subtilis en respuesta a diversas condiciones de crecimiento y señales medio-ambientales. . _x000D_ _x000D_ Así, esta propuesta toma como modelo nuestro trabajo en E. coli sobre el análisis topológico de su red de regulación de la red que considera la relación topológica que existe entre los FTs de la red de regulación transcripcional, donde factores sigma no son evaluados como parte de esta red. El trabajo de mi ex alumna de licenciatura Alejandra Manjares sobre la red de regulación de B. subtilis, en donde a diferencia del trabajo en E. coli, tomamos un enfoque intermedio que considera a todos los FTs, factores sigma excepto a al factor SigmaA (se explica mas ampliamente en el protocolo), con la cual determinamos que esta subred es libre de escala y que sigue un comportamiento de tipo jerárquico modular. Este estudio, nos permitió encontrar módulos con elementos relacionados con funciones biológicas homogéneas en donde algunos de ellos se encuentra ligados entre sí a través de FTs, que definimos como intermodulares debido a que conectan a uno a mas módulos. A esto FTs intermodulares proponemos inactivarlos con la idea de encontrar la influencia que tienen en la estructura de la red y tratar entender que alternativas toma la bacteria ante la ausencia de ellos. El análisis de los efectos sobre la red se realizará a través de experimentos de microarreglos sobre los cuales se calcularán las modificaciones en las propiedades estadísticas y la reorganización que los módulos presenten. _x000D_
Tema
Bioinformática; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN200612

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