dor_id: 1501295

506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

harvesting_group: ColeccionesUniversitarias

270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

883.#.#.a: Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

590.#.#.a: Administración central

883.#.#.1: http://www.ccud.unam.mx/

883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

850.#.#.a: Universidad Nacional Autónoma de México

856.4.0.u: http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN214909

100.1.#.a: Federico Esteban Sánchez Rodríguez

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Federico Esteban Sánchez Rodríguez

245.1.0.a: El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Instituto de Biotecnología, UNAM

264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Señalización en la interacción planta-microorganismos; Biología molecular y genética

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: El establecimiento de la asociación simbiótica entre bacterias del género Rhizobium y leguminosas es un proceso complejo que involucra la activación específica de genes en ambos simbiontes, el intercambio de señales químicas y la activación de un programa de morfogénesis de la planta finamente regulado el cual culmina con la formación de nódulos en las raíces de la planta. Los nódulos son órganos especializados que proveen de todas las condiciones morfológicas y fisiológicas requeridas para llevar a cabo el proceso de fijación simbiótica del nitrógeno. Muchas proteínas de la planta se inducen durante el proceso simbiótico, y muchas de ellas muestran una expresión específica o aumentada en los nódulos. A estas proteínas se les conoce colectivamente como nodulinas. Muchos de los genes reportados que se inducen durante la nodulación codifican para miembros de varias familias de proteasas, principalmente cistein proteasas, aunque también se han descrito serin proteasas, metaloproteasas y aspartil proteasas (APs). Las Aspartil proteasas APs son un tipo de proteasas que están ampliamente distribuidas en animales; microorganismos y virus; y plantas. La función de aspartil proteasas de la subfamilia A1B sólo se conoce para algunos pocos miembros, entre los que están CDR1 y PCS1 de Arabidopsis thaliana. Mientras CDR1 actúa en la señalización de resistencia a patógenos, PCS1 previene la muerte celular durante la gametogénesis y embriogénesis. Tanto las secuencias parciales de aminoácidos de Npv41 como la secuencia de la clona genómica (npv41) presentan alta similitud con asprtil proteasas de plantas compuestas por una sola cadena. Una de las proteínas con más alta identidad a la Npv41 (43 % identidad de aminoácidos) es la aspartil proteasa CDR1 de Arabidopsis thaliana, la cual como se mencionó previamente le proporciona resistencia a Pseudomonas syringae cuando se sobre-expresa, lo cual sugiere que probablemente Npv41 tenga un papel en la defensa de la planta durante la simbiosis. CDR1 en Arabidopsis es una proteasa extracelular. Tenemos evidencias preliminares que indican que Npv41 se encuentra localizada tanto en sitios discretos (posiblemente el retículo endoplásmico) del citoplasma de las células infectadas y en la región apoplástica de las células infectadas. Ambas localizaciones concuerdan con las posibles funciones que esta proteasa pueda tener durante la organogénesis del nódulo: una función de chaperona molecular en el retículo endoplásmico y otra función en la región extracelular (producción de una molécula de señalización?), lo cual concuerda con el hecho de que Npv41 tiene un péptido señal (para la vía secretoria) y por inmunolocalización (microscopía confocal) se detecta en zonas discretas y particuladas del citoplasma de las células infectadas y en la región apoplástica alrededor de las células infectadas. En base estos datos pensamos que la aportación más relevante de este proyecto se centra en contestar las tres preguntas fundamentales en la frontera de la interacción de las plantas con microorganismos y en particular en la interacción simbiótica de frijol con su microsimbionte: ¿Tiene que ver la función de la Npv41 con la defensa (inmunidad innata) del frijol durante la interacción simbiótica, por ejemplo restringiendo el número total de células infectadas en nódulo? ¿Participa la Npv41 durante el desarrollo del nódulo, evitando la muerte celular al funcionar como una chaperona molecular y disminuir la respuesta a la toxicidad en el retículo endoplásmico de las células infectadas, en los nódulos de frijol? ¿La función de la Npv41 en el apoplasto está relacionada con la señalización hacia a la parte aérea a través de producir una molécula señal (péptido) que regule las infecciones secundarias de Rhizobium en las raíces de frijol mediante el proceso conocido como "autorregulación del nódulo" ? La manera en que proponemos investigar la función del gen npv41 es induciendo la pérdida de función por medio de la expresión de un RNAi en raíces transgénicas del frijol común. Asimismo, proponemos estudiar el posible papel del gen npv41 induciendo la ganancia de función mediante la sobre-expresión de una fusión traduccional p35S::npv41-GFP-His. El análisis fenológico de las plantas con pérdida y ganancia de función (fenotipos) del gen npv41 se llevará a cabo mediante RT-PCR tiempo real (qRT-PCR), western-blot, microscopía óptica y electrónica. Este enfoque nos permitirá además determinar con mayor precisión la localización subcelular de la proteína de fusión Npv41-GFP por microscopía electrónica y confocal. También proponemos identificar los posibles ligandos/blancos de Npv41 en nódulos de frijol mediante el sistema de dos híbridos en levadura (S. cereviciae) y enfoques bioquímico-inmunológicos para aislar complejos proteicos asociados a Npv41 que combinados con micro-secuencia automatizada tipo Edman nos podrá indicar los interactores y posibles blancos de esta proteasa. Además, proponemos aislar, caracterizar y secuenciar péptidos que se encuentren enriquecidos en la savia de plantas con ganancia vs pérdida de función de npv41 ya que es posible que Npv41 esté produciendo una señalización sistémica como se ha propuesto que lo hace su homólogo (CDR1) en Arabidopsis. Finalmente, los resultados generados serán presentados en foros nacionales e internacionales y publicados en revistas con índice de alto impacto y se formarán recursos humanos a nivel de licenciatura y postgrado.

046.#.#.j: 2019-11-14 12:26:40.706

264.#.1.b: Dirección General de Asuntos del Personal Académico

handle: 00f49bf764f7f29e

harvesting_date: 2019-11-14 12:26:40.706

856.#.0.q: text/html

last_modified: 2019-11-22 00:00:00

license_url: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es

license_type: by

No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris

Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biotecnología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
El papel de la proteasa extracelular P41 en la defensa y el desarrollo en Phaseolus vulgaris
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Federico Esteban Sánchez Rodríguez
Fecha
2009
Descripción
El establecimiento de la asociación simbiótica entre bacterias del género Rhizobium y leguminosas es un proceso complejo que involucra la activación específica de genes en ambos simbiontes, el intercambio de señales químicas y la activación de un programa de morfogénesis de la planta finamente regulado el cual culmina con la formación de nódulos en las raíces de la planta. Los nódulos son órganos especializados que proveen de todas las condiciones morfológicas y fisiológicas requeridas para llevar a cabo el proceso de fijación simbiótica del nitrógeno. Muchas proteínas de la planta se inducen durante el proceso simbiótico, y muchas de ellas muestran una expresión específica o aumentada en los nódulos. A estas proteínas se les conoce colectivamente como nodulinas. Muchos de los genes reportados que se inducen durante la nodulación codifican para miembros de varias familias de proteasas, principalmente cistein proteasas, aunque también se han descrito serin proteasas, metaloproteasas y aspartil proteasas (APs). Las Aspartil proteasas APs son un tipo de proteasas que están ampliamente distribuidas en animales; microorganismos y virus; y plantas. La función de aspartil proteasas de la subfamilia A1B sólo se conoce para algunos pocos miembros, entre los que están CDR1 y PCS1 de Arabidopsis thaliana. Mientras CDR1 actúa en la señalización de resistencia a patógenos, PCS1 previene la muerte celular durante la gametogénesis y embriogénesis. Tanto las secuencias parciales de aminoácidos de Npv41 como la secuencia de la clona genómica (npv41) presentan alta similitud con asprtil proteasas de plantas compuestas por una sola cadena. Una de las proteínas con más alta identidad a la Npv41 (43 % identidad de aminoácidos) es la aspartil proteasa CDR1 de Arabidopsis thaliana, la cual como se mencionó previamente le proporciona resistencia a Pseudomonas syringae cuando se sobre-expresa, lo cual sugiere que probablemente Npv41 tenga un papel en la defensa de la planta durante la simbiosis. CDR1 en Arabidopsis es una proteasa extracelular. Tenemos evidencias preliminares que indican que Npv41 se encuentra localizada tanto en sitios discretos (posiblemente el retículo endoplásmico) del citoplasma de las células infectadas y en la región apoplástica de las células infectadas. Ambas localizaciones concuerdan con las posibles funciones que esta proteasa pueda tener durante la organogénesis del nódulo: una función de chaperona molecular en el retículo endoplásmico y otra función en la región extracelular (producción de una molécula de señalización?), lo cual concuerda con el hecho de que Npv41 tiene un péptido señal (para la vía secretoria) y por inmunolocalización (microscopía confocal) se detecta en zonas discretas y particuladas del citoplasma de las células infectadas y en la región apoplástica alrededor de las células infectadas. En base estos datos pensamos que la aportación más relevante de este proyecto se centra en contestar las tres preguntas fundamentales en la frontera de la interacción de las plantas con microorganismos y en particular en la interacción simbiótica de frijol con su microsimbionte: ¿Tiene que ver la función de la Npv41 con la defensa (inmunidad innata) del frijol durante la interacción simbiótica, por ejemplo restringiendo el número total de células infectadas en nódulo? ¿Participa la Npv41 durante el desarrollo del nódulo, evitando la muerte celular al funcionar como una chaperona molecular y disminuir la respuesta a la toxicidad en el retículo endoplásmico de las células infectadas, en los nódulos de frijol? ¿La función de la Npv41 en el apoplasto está relacionada con la señalización hacia a la parte aérea a través de producir una molécula señal (péptido) que regule las infecciones secundarias de Rhizobium en las raíces de frijol mediante el proceso conocido como "autorregulación del nódulo" ? La manera en que proponemos investigar la función del gen npv41 es induciendo la pérdida de función por medio de la expresión de un RNAi en raíces transgénicas del frijol común. Asimismo, proponemos estudiar el posible papel del gen npv41 induciendo la ganancia de función mediante la sobre-expresión de una fusión traduccional p35S::npv41-GFP-His. El análisis fenológico de las plantas con pérdida y ganancia de función (fenotipos) del gen npv41 se llevará a cabo mediante RT-PCR tiempo real (qRT-PCR), western-blot, microscopía óptica y electrónica. Este enfoque nos permitirá además determinar con mayor precisión la localización subcelular de la proteína de fusión Npv41-GFP por microscopía electrónica y confocal. También proponemos identificar los posibles ligandos/blancos de Npv41 en nódulos de frijol mediante el sistema de dos híbridos en levadura (S. cereviciae) y enfoques bioquímico-inmunológicos para aislar complejos proteicos asociados a Npv41 que combinados con micro-secuencia automatizada tipo Edman nos podrá indicar los interactores y posibles blancos de esta proteasa. Además, proponemos aislar, caracterizar y secuenciar péptidos que se encuentren enriquecidos en la savia de plantas con ganancia vs pérdida de función de npv41 ya que es posible que Npv41 esté produciendo una señalización sistémica como se ha propuesto que lo hace su homólogo (CDR1) en Arabidopsis. Finalmente, los resultados generados serán presentados en foros nacionales e internacionales y publicados en revistas con índice de alto impacto y se formarán recursos humanos a nivel de licenciatura y postgrado.
Tema
Señalización en la interacción planta-microorganismos; Biología molecular y genética
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN214909

Enlaces