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336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

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100.1.#.a: Marcela Ayala Aceves

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720.#.#.a: Marcela Ayala Aceves

245.1.0.a: Determinación de las rutas de transferencia de electrones en oxidoreductasas utilizando herramientas computacionales híbridas QM/MM

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506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2012, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

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500.#.#.a: Este proyecto propone estudiar de forma teórica la catálisis en enzimas oxidativas con interés biotecnológico, empleando herramientas computacionales en las que se combinan dos enfoques: el mecanoclásico y el mecanocuántico. La ventaja de este enfoque híbrido aplicado a proteínas permite incluir en las simulaciones un gran número de átomos, incluyendo solvente, definiendo de forma cuántica el sitio activo y el resto de forma clásica, permitiendo que los modelos sean más próximos a la realidad. Esta estrategia se ha utilizado en otros grupos para estudiar transferencia de electrones en enzimas oxidativas, particularmente metaloenzimas que por contener metales de transición en el sitio activo representan un reto desde el punto de vista teórico. En este proyecto se propone aplicar esta herramienta a eventos moleculares muy concretos asociados a la transferencia de electrones, que se presentan en una variedad de enzimas. Específicamente se propone estudiar a) los procesos de autoinactivación en peroxidasas, presentes en todas las enzimas de este tipo (plantas, baterias y hongos) y que representa uno de los obstáculos para la utilización a gran escala de estas enzimas y b) el mecanismo y ruta de transferencia de electrones en el sitio activo de la lacasa. Resulta novedoso aplicar esta herramienta a ambos casos de estudio, debido a que son fenómenos que no se comprenden en su totalidad, que son relevantes desde el punto de vista biotecnológico y que podría generar conocimiento y metodologías nuevas para la manipulación de la estabilidad y catálisis de estas enzimas.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Determinación de las rutas de transferencia de electrones en oxidoreductasas utilizando herramientas computacionales híbridas QM/MM

Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biotecnología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Determinación de las rutas de transferencia de electrones en oxidoreductasas utilizando herramientas computacionales híbridas QM/MM", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Determinación de las rutas de transferencia de electrones en oxidoreductasas utilizando herramientas computacionales híbridas QM/MM
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Marcela Ayala Aceves
Fecha
2012
Descripción
Este proyecto propone estudiar de forma teórica la catálisis en enzimas oxidativas con interés biotecnológico, empleando herramientas computacionales en las que se combinan dos enfoques: el mecanoclásico y el mecanocuántico. La ventaja de este enfoque híbrido aplicado a proteínas permite incluir en las simulaciones un gran número de átomos, incluyendo solvente, definiendo de forma cuántica el sitio activo y el resto de forma clásica, permitiendo que los modelos sean más próximos a la realidad. Esta estrategia se ha utilizado en otros grupos para estudiar transferencia de electrones en enzimas oxidativas, particularmente metaloenzimas que por contener metales de transición en el sitio activo representan un reto desde el punto de vista teórico. En este proyecto se propone aplicar esta herramienta a eventos moleculares muy concretos asociados a la transferencia de electrones, que se presentan en una variedad de enzimas. Específicamente se propone estudiar a) los procesos de autoinactivación en peroxidasas, presentes en todas las enzimas de este tipo (plantas, baterias y hongos) y que representa uno de los obstáculos para la utilización a gran escala de estas enzimas y b) el mecanismo y ruta de transferencia de electrones en el sitio activo de la lacasa. Resulta novedoso aplicar esta herramienta a ambos casos de estudio, debido a que son fenómenos que no se comprenden en su totalidad, que son relevantes desde el punto de vista biotecnológico y que podría generar conocimiento y metodologías nuevas para la manipulación de la estabilidad y catálisis de estas enzimas.
Tema
Biocatálisis; Biotecnología
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN201612

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