dor_id: 4119970

506.#.#.a: Público

590.#.#.d: Los artículos enviados a TIP Revista especializada en ciencias químico-biológicas se juzgan por medio de un proceso de revisión por pares

510.0.#.a: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT), Sistema Regional de Información en Línea para Revistas Científicas de América Latina, el Caribe, España y Portugal (Latindex) Scientific Electronic Library Online (SciELO), La Red de Revistas Científicas de América Latina y el Caribe, España y Portugal (Redalyc), Directory of Open Access Journals (DOAJ), Web Of Science (WoS), EBSCO, Medigraphic, Indice de Revistas Latinoamericanas en Ciencias (Periódica)

561.#.#.u: https://www.zaragoza.unam.mx/

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: article

336.#.#.3: Artículo de Investigación

336.#.#.a: Artículo

351.#.#.6: http://tip.zaragoza.unam.mx/index.php/tip/index

351.#.#.b: TIP Revista especializada en Ciencias Químico-Biológicas

351.#.#.a: Artículos

harvesting_group: RevistasUNAM

270.1.#.p: Revistas UNAM. Dirección General de Publicaciones y Fomento Editorial, UNAM en revistas@unam.mx

590.#.#.c: Open Journal Systems (OJS)

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: http://www.revistas.unam.mx/front/

883.#.#.a: Revistas UNAM

590.#.#.a: Coordinación de Difusión Cultural, UNAM

883.#.#.1: https://www.publicaciones.unam.mx/

883.#.#.q: Dirección General de Publicaciones y Fomento Editorial, UNAM

850.#.#.a: Universidad Nacional Autónoma de México

856.4.0.u: http://tip.zaragoza.unam.mx/index.php/tip/article/view/121/121

100.1.#.a: Camel, Vladimir; Galeano, Esteban; Carrer, Helaine

524.#.#.a: Camel, Vladimir, et al. (2017). Coexpression Network of 320 genes of Tectona grandis involved in abiotic stress and xylogenesis processes. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas; Vol. 20, Núm. 2, 2017; 5-14. Recuperado de https://repositorio.unam.mx/contenidos/4119970

245.1.0.a: Coexpression Network of 320 genes of Tectona grandis involved in abiotic stress and xylogenesis processes

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, UNAM

264.#.0.c: 2017

264.#.1.c: 2017-05-18

653.#.#.a: Systems biology; functional enrichment; differentially expressed genes; text mining; gene ontology; biología de sistemas; enriquecimiento funcional; genes diferencialmente expresados; minería de literatura; ontología génica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de esta obra pertenece a las instituciones editoras. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY-NC-ND 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2017-05-18, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio del correo electrónico revistatip@yahoo.com

884.#.#.k: http://tip.zaragoza.unam.mx/index.php/tip/article/view/121

001.#.#.#: oai:ojs.ojs.escire.net:article/121

041.#.7.h: spa

520.3.#.a: Teak (Tectona grandis) is a timber tree of economic importance in tropical and subtropical forests. The aim of this work was to identify families of transcription factors (TFs) and enzyme-coding genes differentially expressed (DREs) in stem xylem and their regulation involved in abiotic stress response and xylogenesis in T. grandis. Therefore, the evolutionary distribution of 19 TFs of T. grandis was derived using a phylogenetic analysis. Besides, specific data mining procedures of databases and publications were performed in order to identify 320 Arabidopsis thaliana genes (orthologous to T. grandis) as experimental and predictive support. As results, we found transcription factors of the bZIP, MYB, NAC, ER, bhlh families, and enzyme-coding genes. Furthermore, interactome analysis in T. grandis showed a significant Pearson correlation for genes regulating metabolic pathways of phenylpropanoids and abiotic stress. Also, the coexpression network revealed nodes and edges between TgRAP1, TgMyB1, TgHSF1, TgMyB3, TgNAC1, TgTsiid1, TgLieTFs1, TgNuy3, TgRAP2 and TgNuy4 genes. Gene ontology analyses showed that 31 genes respond to abiotic stress, mainly TgHShT1, TgHSF1 and TgHSF2, as co-regulators. In addition, the TFs master regulator TgNAC1 was found to be involved in the co-regulation of other TFs.   Tectona grandis es un árbol maderable de importancia económica en bosques tropicales y subtropicales. Mediante este estudio, se identificaron familias de factores de transcripción (FTs) y genes codificantes para enzima, diferencialmente expresados en el xilema del tallo, implicados en la regulación de la respuesta a estrés abiótico y xilogénesis en T. grandis. Así, fue analizada la distribución evolutiva de 19 genes codificantes para FTs de T. grandis mediante análisis filogenéticos. También, fue utilizada la minería de bases de datos y publicaciones para identificar 320 genes de Arabidopsis thaliana (ortólogos a T. grandis) como soporte experimental y predictivo. Como resultados, se encontraron FTs de las familias bZIP, MYB, NAC, ER, bhlh, NuY y genes que codifican enzimas. Así mismo, se logró analizar el interactoma de T. grandis encontrando correlaciones de Pearson significativas para genes que regulan vías metabólicas de fenilpropanoides y estrés abiótico. Además, la red de coexpresión reveló nodos y aristas entre los genes TgRAP1, TgMyB1, TgHSF1, TgMyB3, TgNAC1, TgTsiid1, TgLieTFs1, TgNuy3, TgRAP2 y TgNuy4. En particular, los análisis de ontología génica mostraron 31 genes de respuesta a estrés abiótico, principalmente TgHShT1, TgHSF1 y TgHSF2 como correguladores. Además, se encontró que el regulador maestro TgNAC1, está involucrado en la corregulación de otros factores de transcripción.

773.1.#.t: TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas; Vol. 20, Núm. 2 (2017); 5-14

773.1.#.o: http://tip.zaragoza.unam.mx/index.php/tip/index

046.#.#.j: 2021-10-20 00:00:00.000000

022.#.#.a: ISSN electrónico: 2395-8723; ISSN impreso: 1405-888X

310.#.#.a: Semestral

300.#.#.a: Páginas: 5-14

264.#.1.b: Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, UNAM

758.#.#.1: http://tip.zaragoza.unam.mx/index.php/tip/index

doi: https://doi.org/10.1016/j.recqb.2017.04.001

handle: 009d8ba7c6563fc9

856.#.0.q: application/pdf

file_creation_date: 2017-05-09 20:32:34.0

file_modification_date: 2017-05-09 20:32:41.0

file_name: 7d0171abc78667a84830359b5ca6df897f659090ac9a4513f24be7842b3af3e4.pdf

file_pages_number: 10

file_format_version: application/pdf; version=1.4

file_size: 4243952

245.1.0.b: Red de coexpresión de 320 genes de tectona grandis relacionados con procesos de estrés abiótico y xilogénesis

last_modified: 2021-11-09 13:10:00

license_url: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/legalcode.es

license_type: by-nc-nd

No entro en nada

No entro en nada 2