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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

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100.1.#.a: Otto Geiger

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Cambios del transcriptoma, del proteoma y de funciones causados por lípidos de membrana", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Otto Geiger

245.1.0.a: Cambios del transcriptoma, del proteoma y de funciones causados por lípidos de membrana

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264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

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653.#.#.a: Biosíntesis de lípidos en bacterias; Bioquímica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Aunque existen varios estudios de como la ausencia de distintos lípidos de membrana causan fenotipos pleiotrópicos en bacterias, generalmente los mecanismos causantes no son conocidos. La bacteria Sinorhizobium meliloti posee además de los fosfolípidos aniónicos fosfatidilglicerol y cardiolipina los fosfolípidos zwiteriónicos fosfatidiletanolamina (PE) y fosfatidilcolina (PC) como principales lípidos de la membrana. Hemos construido mutantes de S. meliloti que carecen de PE o de PC. PC se puede entender como una versión trimetilada en el grupo amino de PE y así su cabeza hidrofilica es de mayor tamaño que la de PE. Sorprendentemente, mutantes que carecen de uno de los fosfolípidos zwiteriónicos (PC o PE) muestran transcriptomas distintos de la cepa silvestre y distintos entre ellos. La mutante deficiente de PE muestra un incremento de transcritos involucrados en la degradación de compuestos C1 como de metanol o formaldehido. En contraste, transcritos que codifican para proteínas involucradas en la importación de hierro y la degradación de rizopina via myo-inositol son decrementados en la mutante. La mutante deficiente de PC muestra un incremento de transcritos que codifican para proteínas hipotéticas pequeñas que llevan una α-helice transmembranal. Una de ellas, SMc01855 (Slt) probablemente degrada a mureina y sobreexpresión de Slt en E. coli causa autolisis, hecho que podría explicar la sensibilidad a estrés osmótico de la mutante rizobial. En contraste, transcritos que codifican para proteínas involucradas en la formación del flagelo y de pili estan decrementados en la mutante. En el proyecto propuesto queremos estudiar si los cambios transcripcionales observados en mutantes de S. meliloti deficientes de PC o de PE son realizados a nivel proteómico y a nivel funcional. Queremos definir si mutantes deficientes de PE pueden utilizar compuestos de C1 como fuentes de carbono o de energía, si esta vía está incrementada y si la mutante está afectada en la producción o utilización del sideróforo rizobactina, del importe de hierro o en la degradación de rizopina o myo-inositol. También queremos definir si mutantes de S. meliloti deficientes de PC pueden producir más de la transglucosilasa litica SMc01855 y si eso causa su inestabilidad osmótica. Queremos confirmar que una mutante deficiente de PC no se mueve, no forma flagelos ni flagelina. Hasta la fecha no se conocen mecanismos moleculares por los cuales la membrana bacteriana pueda efectuar a la transcripción. Por eso queremos revelar el mecanismo molecular de cómo una mutante de S. meliloti deficiente de PC no forma flagelos.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Cambios del transcriptoma, del proteoma y de funciones causados por lípidos de membrana

Centro de Ciencias Genómicas, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Cambios del transcriptoma, del proteoma y de funciones causados por lípidos de membrana", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Cambios del transcriptoma, del proteoma y de funciones causados por lípidos de membrana
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Otto Geiger
Fecha
2009
Descripción
Aunque existen varios estudios de como la ausencia de distintos lípidos de membrana causan fenotipos pleiotrópicos en bacterias, generalmente los mecanismos causantes no son conocidos. La bacteria Sinorhizobium meliloti posee además de los fosfolípidos aniónicos fosfatidilglicerol y cardiolipina los fosfolípidos zwiteriónicos fosfatidiletanolamina (PE) y fosfatidilcolina (PC) como principales lípidos de la membrana. Hemos construido mutantes de S. meliloti que carecen de PE o de PC. PC se puede entender como una versión trimetilada en el grupo amino de PE y así su cabeza hidrofilica es de mayor tamaño que la de PE. Sorprendentemente, mutantes que carecen de uno de los fosfolípidos zwiteriónicos (PC o PE) muestran transcriptomas distintos de la cepa silvestre y distintos entre ellos. La mutante deficiente de PE muestra un incremento de transcritos involucrados en la degradación de compuestos C1 como de metanol o formaldehido. En contraste, transcritos que codifican para proteínas involucradas en la importación de hierro y la degradación de rizopina via myo-inositol son decrementados en la mutante. La mutante deficiente de PC muestra un incremento de transcritos que codifican para proteínas hipotéticas pequeñas que llevan una α-helice transmembranal. Una de ellas, SMc01855 (Slt) probablemente degrada a mureina y sobreexpresión de Slt en E. coli causa autolisis, hecho que podría explicar la sensibilidad a estrés osmótico de la mutante rizobial. En contraste, transcritos que codifican para proteínas involucradas en la formación del flagelo y de pili estan decrementados en la mutante. En el proyecto propuesto queremos estudiar si los cambios transcripcionales observados en mutantes de S. meliloti deficientes de PC o de PE son realizados a nivel proteómico y a nivel funcional. Queremos definir si mutantes deficientes de PE pueden utilizar compuestos de C1 como fuentes de carbono o de energía, si esta vía está incrementada y si la mutante está afectada en la producción o utilización del sideróforo rizobactina, del importe de hierro o en la degradación de rizopina o myo-inositol. También queremos definir si mutantes de S. meliloti deficientes de PC pueden producir más de la transglucosilasa litica SMc01855 y si eso causa su inestabilidad osmótica. Queremos confirmar que una mutante deficiente de PC no se mueve, no forma flagelos ni flagelina. Hasta la fecha no se conocen mecanismos moleculares por los cuales la membrana bacteriana pueda efectuar a la transcripción. Por eso queremos revelar el mecanismo molecular de cómo una mutante de S. meliloti deficiente de PC no forma flagelos.
Tema
Biosíntesis de lípidos en bacterias; Bioquímica
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN218009

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