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720.#.#.a: Maricarmen Quirasco Baruch

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506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2013, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: El queso Cotija es un alimento artesanal que se elabora a partir de leche cruda de vaca, su maduración ocurre mediante la interacción de la microbiota natural que cambia libremente en un tiempo mínimo de tres meses y que puede prolongarse hasta años. _x000D_ Estudios de este grupo de trabajo han demostrado que existe una gran diversidad de microorganismos en el queso y que pueden provenir principalmente de la sal adicionada, de la atmósfera del local en el que se lleva a cabo la maduración y del contacto con el productor. Utilizando métodos dependientes de cultivo y métodos moleculares basados en PCR se han identificado 9 géneros bacterianos: Bacillus spp., Staphylococcus spp., Enterococcus spp., Lactococcus spp., Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Marinilactibacillus spp., Vagococcus spp. y Virgibacillus spp. Así como 4 especies de levaduras: Candida zeylanoides, Candida parapsilosis, Kluyveromyces lactis y Yarrowia lipolítica. Adicionalmente, en una investigación de este grupo que sirve de antecedente inmediato a la presente propuesta, se concluyó por la técnica de FISH (hibridación in situ con sondas fluorescentes) en un queso característico, que los tres géneros bacterianos identificados con mayor frecuencia, (Bacillus spp., Staphylococcus spp. y Enterococcus spp) representan únicamente el 11% del total de la carga bacteriana sin dominancia de ninguno de ellos._x000D_ Se propone en el desarrollo de este proyecto, describir a la microbiota bacteriana completa presente en una muestra representativa de queso Cotija mediante el análisis del metagenoma a través de la creación de una biblioteca y de la secuenciación masiva del ADN extraído de la microbiota del producto. El estudio de los genomas se realizará a partir de la extracción del material genético de la muestra, mismo que será secuenciado en su totalidad, ensamblado y analizado por medios bioinformáticos, lo que permitirá interpretar e integrar la información. Este método no requiere de amplificación previa, por lo que no tiene los sesgos intrínsecos del PCR, y se ha aplicado con éxito en el análisis de muestras ambientales de distinto grado de complejidad, desde ambientes extremos, hasta ambientes como el microbioma intestinal humano. Este enfoque es de por sí novedoso puesto que la técnica supone un poco más de 10 años, desde que se acuñó el término “Metagenoma” por Jo Handelsman en el año 2000, por lo que prácticamente no existen reportes de análisis de esta índole en alimentos._x000D_ Por otra parte, los estudios realizados en el grupo de trabajo sugieren que la actividad lipolítica tiene una mayor influencia en el desarrollo de características sensoriales distintivas de este producto ya que se han encontrado una mayor cantidad de microorganismos lipolíticos a lo largo del proceso de elaboración y maduración del alimento. En este sentido, se presume que el queso Cotija puede ser fuente importante de enzimas con actividad esterasa con gran potencial biotecnológico. Por lo que se propone construir una biblioteca metagenómica funcional a partir de los microorganismos del queso Cotija, para la búsqueda de actividades lipasa/esterasa. Así mismo, el análisis de secuenciación masiva generará una cantidad de datos lo suficientemente amplia como para permitir el análisis no solo de diversidad bacteriana, sino la búsqueda de actividades metabólicas específicas, lo que da pauta para el desarrollo de trabajos bioinformáticos posteriores.

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Análisis metagenómico de la microbiota del queso Cotija

Facultad de Química, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Facultad de Química, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Análisis metagenómico de la microbiota del queso Cotija", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Análisis metagenómico de la microbiota del queso Cotija
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Maricarmen Quirasco Baruch
Fecha
2013
Descripción
El queso Cotija es un alimento artesanal que se elabora a partir de leche cruda de vaca, su maduración ocurre mediante la interacción de la microbiota natural que cambia libremente en un tiempo mínimo de tres meses y que puede prolongarse hasta años. _x000D_ Estudios de este grupo de trabajo han demostrado que existe una gran diversidad de microorganismos en el queso y que pueden provenir principalmente de la sal adicionada, de la atmósfera del local en el que se lleva a cabo la maduración y del contacto con el productor. Utilizando métodos dependientes de cultivo y métodos moleculares basados en PCR se han identificado 9 géneros bacterianos: Bacillus spp., Staphylococcus spp., Enterococcus spp., Lactococcus spp., Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Marinilactibacillus spp., Vagococcus spp. y Virgibacillus spp. Así como 4 especies de levaduras: Candida zeylanoides, Candida parapsilosis, Kluyveromyces lactis y Yarrowia lipolítica. Adicionalmente, en una investigación de este grupo que sirve de antecedente inmediato a la presente propuesta, se concluyó por la técnica de FISH (hibridación in situ con sondas fluorescentes) en un queso característico, que los tres géneros bacterianos identificados con mayor frecuencia, (Bacillus spp., Staphylococcus spp. y Enterococcus spp) representan únicamente el 11% del total de la carga bacteriana sin dominancia de ninguno de ellos._x000D_ Se propone en el desarrollo de este proyecto, describir a la microbiota bacteriana completa presente en una muestra representativa de queso Cotija mediante el análisis del metagenoma a través de la creación de una biblioteca y de la secuenciación masiva del ADN extraído de la microbiota del producto. El estudio de los genomas se realizará a partir de la extracción del material genético de la muestra, mismo que será secuenciado en su totalidad, ensamblado y analizado por medios bioinformáticos, lo que permitirá interpretar e integrar la información. Este método no requiere de amplificación previa, por lo que no tiene los sesgos intrínsecos del PCR, y se ha aplicado con éxito en el análisis de muestras ambientales de distinto grado de complejidad, desde ambientes extremos, hasta ambientes como el microbioma intestinal humano. Este enfoque es de por sí novedoso puesto que la técnica supone un poco más de 10 años, desde que se acuñó el término “Metagenoma” por Jo Handelsman en el año 2000, por lo que prácticamente no existen reportes de análisis de esta índole en alimentos._x000D_ Por otra parte, los estudios realizados en el grupo de trabajo sugieren que la actividad lipolítica tiene una mayor influencia en el desarrollo de características sensoriales distintivas de este producto ya que se han encontrado una mayor cantidad de microorganismos lipolíticos a lo largo del proceso de elaboración y maduración del alimento. En este sentido, se presume que el queso Cotija puede ser fuente importante de enzimas con actividad esterasa con gran potencial biotecnológico. Por lo que se propone construir una biblioteca metagenómica funcional a partir de los microorganismos del queso Cotija, para la búsqueda de actividades lipasa/esterasa. Así mismo, el análisis de secuenciación masiva generará una cantidad de datos lo suficientemente amplia como para permitir el análisis no solo de diversidad bacteriana, sino la búsqueda de actividades metabólicas específicas, lo que da pauta para el desarrollo de trabajos bioinformáticos posteriores.
Tema
Biología molecular aplicada a ecología microbiana en alimentos; Biotecnología
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN218613

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