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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias

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336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

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100.1.#.a: Enrique Salas Vidal

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720.#.#.a: Enrique Salas Vidal

245.1.0.a: Análisis de las redes de regulación genética moduladas por las Rho GTPasas Rac1 y Cdc42 involucradas en el control de la migración celular durante el desarrollo temprano del pez cebra

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.0.c: 2012

264.#.1.c: 2012

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Biología del desarrollo; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2012, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Las Rho GTPasas son proteínas monoméricas que participan en el control de procesos celulares como la proliferación, la apoptosis, la migración celular, la polaridad celular, el tráfico de la membrana, la regulación de la dinámica del citoesqueleto y la regulación de la transcripción genética. Recientemente identificamos 34 miembros de la familia de Rho GTPasas del pez cebra (Salas-Vidal et al., 2005 y resultados sin publicar). Actualmente estamos enfocados en la caracterización de las funciones que llevan a cabo Rac1 y Cdc42 en el desarrollo embrionario temprano del pez cebra. Del proyecto previo financiado por DGAPA, obtuvimos avances importantes, los cuales se describen a continuación. El pez cebra Danio rerio, a diferencia de otros vertebrados que presentan copias únicas de cada gen, tiene dos copias del gen de rac1 y tres copias del gen de cdc42, denominadas rac1, rac1l, cdc42, cdc42l y cdc42l2. Diferentes análisis bioinformáticos mostraron que las copias de estos genes en pez cebra presentan una estructura genómica conservada con respecto a los genes de humano. Análisis filogenéticos indican que los genes de rac1 y cdc42 son los más conservados con respecto a los genes de humano, y rac1l, cdc42l y cdc42l2 son más divergentes. Por medio de reacciones de RT-PCR, hibridación in situ e inmunohistoquímica encontramos que estos genes y sus productos se expresan de manera ubicua a lo largo del desarrollo de pez cebra. Al provocar la pérdida de función de Rac1 y Cdc42l con oligonucleótidos antisentido, tipo morfolinos, encontramos efectos tempranos en el desarrollo en diferentes procesos que involucran a la migración celular. Encontramos efectos en la epibolia y la gastrulación (cdc42l) y en la convergencia y extensión (rac1). Logramos confirmar que se afecta al citoesqueleto de actina por medio de histoquímica. Del citoesqueleto de tubulina no pudimos confirmar los efectos por inmunolocalización pero encontramos un incremento muy notable en la cantidad de proteína por medio de western blot (rac1 y cdc42), lo cual sugiere fuertemente que esto podría afectar el comportamiento celular por medio de cambios en la dinámica del citoesqueleto. El análisis del transcriptoma y proteoma mostraron que la pérdida de función de estas Rho GTPasas afecta la expresión de componentes del citoesqueleto como actina y tubulina así como de moléculas reguladoras de la dinámica del citoesqueleto y de la migración celular como rock2, cap1, gelsolin, b-catenina, la anexina V y selenoproteínas como gpx4. Además fue interesante encontrar que también se afectó la expresión de diferentes Rho GTPasas lo cual sugiere que hay redes de interacción entre diferentes Rho GTPasas. _x000D_ En el presente proyecto queremos ahondar en el análisis de los efectos provocados por la pérdida de función de Rac1 y Cdc42 sobre la dinámica de la migración celular y las redes de regulación genética en las que participan durante el desarrollo embrionario temprano del pez cebra.

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Registro de colección universitaria

Análisis de las redes de regulación genética moduladas por las Rho GTPasas Rac1 y Cdc42 involucradas en el control de la migración celular durante el desarrollo temprano del pez cebra

Instituto de Biotecnología, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Instituto de Biotecnología, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Análisis de las redes de regulación genética moduladas por las Rho GTPasas Rac1 y Cdc42 involucradas en el control de la migración celular durante el desarrollo temprano del pez cebra", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Análisis de las redes de regulación genética moduladas por las Rho GTPasas Rac1 y Cdc42 involucradas en el control de la migración celular durante el desarrollo temprano del pez cebra
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
Enrique Salas Vidal
Fecha
2012
Descripción
Las Rho GTPasas son proteínas monoméricas que participan en el control de procesos celulares como la proliferación, la apoptosis, la migración celular, la polaridad celular, el tráfico de la membrana, la regulación de la dinámica del citoesqueleto y la regulación de la transcripción genética. Recientemente identificamos 34 miembros de la familia de Rho GTPasas del pez cebra (Salas-Vidal et al., 2005 y resultados sin publicar). Actualmente estamos enfocados en la caracterización de las funciones que llevan a cabo Rac1 y Cdc42 en el desarrollo embrionario temprano del pez cebra. Del proyecto previo financiado por DGAPA, obtuvimos avances importantes, los cuales se describen a continuación. El pez cebra Danio rerio, a diferencia de otros vertebrados que presentan copias únicas de cada gen, tiene dos copias del gen de rac1 y tres copias del gen de cdc42, denominadas rac1, rac1l, cdc42, cdc42l y cdc42l2. Diferentes análisis bioinformáticos mostraron que las copias de estos genes en pez cebra presentan una estructura genómica conservada con respecto a los genes de humano. Análisis filogenéticos indican que los genes de rac1 y cdc42 son los más conservados con respecto a los genes de humano, y rac1l, cdc42l y cdc42l2 son más divergentes. Por medio de reacciones de RT-PCR, hibridación in situ e inmunohistoquímica encontramos que estos genes y sus productos se expresan de manera ubicua a lo largo del desarrollo de pez cebra. Al provocar la pérdida de función de Rac1 y Cdc42l con oligonucleótidos antisentido, tipo morfolinos, encontramos efectos tempranos en el desarrollo en diferentes procesos que involucran a la migración celular. Encontramos efectos en la epibolia y la gastrulación (cdc42l) y en la convergencia y extensión (rac1). Logramos confirmar que se afecta al citoesqueleto de actina por medio de histoquímica. Del citoesqueleto de tubulina no pudimos confirmar los efectos por inmunolocalización pero encontramos un incremento muy notable en la cantidad de proteína por medio de western blot (rac1 y cdc42), lo cual sugiere fuertemente que esto podría afectar el comportamiento celular por medio de cambios en la dinámica del citoesqueleto. El análisis del transcriptoma y proteoma mostraron que la pérdida de función de estas Rho GTPasas afecta la expresión de componentes del citoesqueleto como actina y tubulina así como de moléculas reguladoras de la dinámica del citoesqueleto y de la migración celular como rock2, cap1, gelsolin, b-catenina, la anexina V y selenoproteínas como gpx4. Además fue interesante encontrar que también se afectó la expresión de diferentes Rho GTPasas lo cual sugiere que hay redes de interacción entre diferentes Rho GTPasas. _x000D_ En el presente proyecto queremos ahondar en el análisis de los efectos provocados por la pérdida de función de Rac1 y Cdc42 sobre la dinámica de la migración celular y las redes de regulación genética en las que participan durante el desarrollo embrionario temprano del pez cebra.
Tema
Biología del desarrollo; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN205612

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