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506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biología y Química

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

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100.1.#.a: María de Lourdes Girard Cuesy

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Análisis de la expresión global mediada por los reguladores StoR y ActR en Rhizobium etli basado en ChIP-onchip", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: María de Lourdes Girard Cuesy

245.1.0.a: Análisis de la expresión global mediada por los reguladores StoR y ActR en Rhizobium etli basado en ChIP-onchip

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

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264.#.0.c: 2009

264.#.1.c: 2009

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Genética y genómica bacteriana; Biología molecular y genética

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2009, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: El nitrógeno es, después del agua, el principal nutriente que limita el desarrollo de las plantas. La fijación biológica de nitrógeno (FBN) aporta la mayor parte del nitrógeno fijado a los ecosistemas terrestres, y es además, un proceso agronómicamente significativo que provee una alternativa al uso de fertilizantes químicos. Para que los beneficios de la FBN puedan repercutir en la mejor calidad de las cosechas y en el aumento de la productividad, es necesario que las interacciones beneficiosas (bacteria-planta) sean cada vez mas entendidas. Las bacterias del género Rhizobium establecen una relación simbiótica con las raíces de las plantas leguminosas en una estructura denominada nódulo, en la cual se realiza la fijación biológica de nitrógeno. La asociación simbiótica rhizobia-leguminosa representa la culminación de una serie de eventos que requiere de la expresión definida y temporal de genes específicos. Las moléculas señal inducen la expresión de genes bacterianos los cuales a su vez inducen la expresión de genes de la planta que provocan cambios en el desarrollo morfológico de las raíces. Rhizobium etli es una bacteria del suelo que establece una relación simbiótica efectiva con plantas de frijol (Phaseolus vulgaris). El modelo de regulación de los genes fix en R. etli CFN42 presenta características novedosas a las reportadas para otros rhizobia: (i)la cascada de regulación de los genes fix inicia con una proteína FixL atípica y con la ausencia de un homólogo estructural a FixJ; (ii) participan reguladores codificados en tres replicones que pertenecen a la familia de reguladores tipo Fnr. Los resultados recientes de nuestro grupo de investigación mostraron la participación de dos novedosos reguladores que pertenecen a la familia de reguladores tipo Fnr llamados StoR, por su participación en la regulación de la expresión y síntesis de la oxidasa simbiótica en R. etli CFN42. Nuestros resultados muestran que stoRd juega un papel represivo durante la simbiosis mientras que stoRf es necesario para una expresión total de la habilidad de fijar nitrógeno de R. etli. El papel funcional contrastante que presentan estos reguladores sobre la fijación de nitrógeno, sugiere que stoRd reprime un grupo de genes que incluye pero que no se limita a las reiteraciones fixNOQP. Por el contrario, stoRf controla, ya sea directa o indirectamente, un grupo de genes diferentes a los controlados por stoRd. En el desarrollo del proyecto evaluaremos la participación de cada uno de los dominios estructurales de StoRd y StoRf en la funcionalidad de las proteínas en el reconocimiento y regulación de sus genes blanco con el propósito de establecer el mecanismo utilizado para ejercer su función reguladora. Por otra parte, el análisis de la cascada de regulación de los genes nif, mediada por la proteína NifA en R. etli CFN42 ha sido limitado. El análisis de la secuencia del genoma de esta bacteria muestra la presencia de un sistema regulador de dos componentes formado por ActSR, sistema de regulación global de dos componentes altamente conservado que participa en la regulación de importantes procesos celulares implicados en la generación y utilización de energía. Los resultados de este proyecto nos permitirán establecer la participación o no de ActR como un elemento adicional en la cascada de regulación de los genes nif en R. etli y su participación en la conectividad de ambas vías de regulación. En este proyecto, utilizaremos herramientas genéticas complementadas con herramientas genómicas, con el objetivo de analizar el patrón de expresión de los reguladores StoR y ActR de R. etli, tanto en vida libre como en simbiosis. Para ello, utilizaremos cepas mutantes en dichos genes o cepas que los sobre-expresen para hacer un análisis fenotípico Para identificar el grupo de genes bajo el control de cada proteína implementaremos en nuestro modelo de investigación la metodología conocida como ChIP-onchip (experimentos de interacción global con el DNA-Proteínas a través de inmunoprecipitación de cromatina acoplados con microarreglos ).

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No entro en nada

No entro en nada 2

Registro de colección universitaria

Análisis de la expresión global mediada por los reguladores StoR y ActR en Rhizobium etli basado en ChIP-onchip

Centro de Ciencias Genómicas, UNAM, Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

Licencia de uso

Procedencia del contenido

Entidad o dependencia
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM
Entidad o dependencia
Dirección General de Asuntos del Personal Académico
Acervo
Colecciones Universitarias Digitales
Repositorio
Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias
Contacto
Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

Cita

Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Análisis de la expresión global mediada por los reguladores StoR y ActR en Rhizobium etli basado en ChIP-onchip", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

Descripción del recurso

Título
Análisis de la expresión global mediada por los reguladores StoR y ActR en Rhizobium etli basado en ChIP-onchip
Colección
Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)
Responsable
María de Lourdes Girard Cuesy
Fecha
2009
Descripción
El nitrógeno es, después del agua, el principal nutriente que limita el desarrollo de las plantas. La fijación biológica de nitrógeno (FBN) aporta la mayor parte del nitrógeno fijado a los ecosistemas terrestres, y es además, un proceso agronómicamente significativo que provee una alternativa al uso de fertilizantes químicos. Para que los beneficios de la FBN puedan repercutir en la mejor calidad de las cosechas y en el aumento de la productividad, es necesario que las interacciones beneficiosas (bacteria-planta) sean cada vez mas entendidas. Las bacterias del género Rhizobium establecen una relación simbiótica con las raíces de las plantas leguminosas en una estructura denominada nódulo, en la cual se realiza la fijación biológica de nitrógeno. La asociación simbiótica rhizobia-leguminosa representa la culminación de una serie de eventos que requiere de la expresión definida y temporal de genes específicos. Las moléculas señal inducen la expresión de genes bacterianos los cuales a su vez inducen la expresión de genes de la planta que provocan cambios en el desarrollo morfológico de las raíces. Rhizobium etli es una bacteria del suelo que establece una relación simbiótica efectiva con plantas de frijol (Phaseolus vulgaris). El modelo de regulación de los genes fix en R. etli CFN42 presenta características novedosas a las reportadas para otros rhizobia: (i)la cascada de regulación de los genes fix inicia con una proteína FixL atípica y con la ausencia de un homólogo estructural a FixJ; (ii) participan reguladores codificados en tres replicones que pertenecen a la familia de reguladores tipo Fnr. Los resultados recientes de nuestro grupo de investigación mostraron la participación de dos novedosos reguladores que pertenecen a la familia de reguladores tipo Fnr llamados StoR, por su participación en la regulación de la expresión y síntesis de la oxidasa simbiótica en R. etli CFN42. Nuestros resultados muestran que stoRd juega un papel represivo durante la simbiosis mientras que stoRf es necesario para una expresión total de la habilidad de fijar nitrógeno de R. etli. El papel funcional contrastante que presentan estos reguladores sobre la fijación de nitrógeno, sugiere que stoRd reprime un grupo de genes que incluye pero que no se limita a las reiteraciones fixNOQP. Por el contrario, stoRf controla, ya sea directa o indirectamente, un grupo de genes diferentes a los controlados por stoRd. En el desarrollo del proyecto evaluaremos la participación de cada uno de los dominios estructurales de StoRd y StoRf en la funcionalidad de las proteínas en el reconocimiento y regulación de sus genes blanco con el propósito de establecer el mecanismo utilizado para ejercer su función reguladora. Por otra parte, el análisis de la cascada de regulación de los genes nif, mediada por la proteína NifA en R. etli CFN42 ha sido limitado. El análisis de la secuencia del genoma de esta bacteria muestra la presencia de un sistema regulador de dos componentes formado por ActSR, sistema de regulación global de dos componentes altamente conservado que participa en la regulación de importantes procesos celulares implicados en la generación y utilización de energía. Los resultados de este proyecto nos permitirán establecer la participación o no de ActR como un elemento adicional en la cascada de regulación de los genes nif en R. etli y su participación en la conectividad de ambas vías de regulación. En este proyecto, utilizaremos herramientas genéticas complementadas con herramientas genómicas, con el objetivo de analizar el patrón de expresión de los reguladores StoR y ActR de R. etli, tanto en vida libre como en simbiosis. Para ello, utilizaremos cepas mutantes en dichos genes o cepas que los sobre-expresen para hacer un análisis fenotípico Para identificar el grupo de genes bajo el control de cada proteína implementaremos en nuestro modelo de investigación la metodología conocida como ChIP-onchip (experimentos de interacción global con el DNA-Proteínas a través de inmunoprecipitación de cromatina acoplados con microarreglos ).
Tema
Genética y genómica bacteriana; Biología molecular y genética
Identificador global
http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN202109

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