dor_id: 1500955

506.#.#.a: Público

650.#.4.x: Biotecnología y Ciencias Agropecuarias

336.#.#.b: other

336.#.#.3: Registro de colección de proyectos

336.#.#.a: Registro de colección universitaria

351.#.#.b: Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT)

351.#.#.a: Colecciones Universitarias Digitales

harvesting_group: ColeccionesUniversitarias

270.1.#.p: Dirección General de Repositorios Universitarios. contacto@dgru.unam.mx

590.#.#.c: Otro

270.#.#.d: MX

270.1.#.d: México

590.#.#.b: Concentrador

883.#.#.u: https://datosabiertos.unam.mx/

883.#.#.a: Portal de Datos Abiertos UNAM, Colecciones Universitarias

590.#.#.a: Administración central

883.#.#.1: http://www.ccud.unam.mx/

883.#.#.q: Dirección General de Repositorios Universitarios

850.#.#.a: Universidad Nacional Autónoma de México

856.4.0.u: http://datosabiertos.unam.mx/DGAPA:PAPIIT:IN203211

100.1.#.a: Enrique Merino Pérez

524.#.#.a: Dirección de Desarrollo Académico, Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA). "Análisis de la energía de desestabilización y curvatura estática del DNA como elementos de la regulación transcripcional en Genomas y Metagenomas", Proyectos Universitarios PAPIIT (PAPIIT). En "Portal de datos abiertos UNAM" (en línea), México, Universidad Nacional Autónoma de México.

720.#.#.a: Enrique Merino Pérez

245.1.0.a: Análisis de la energía de desestabilización y curvatura estática del DNA como elementos de la regulación transcripcional en Genomas y Metagenomas

502.#.#.c: Universidad Nacional Autónoma de México

561.1.#.a: Instituto de Biotecnología, UNAM

264.#.0.c: 2011

264.#.1.c: 2011

307.#.#.a: 2019-05-23 18:40:21.491

653.#.#.a: Bioinformática; Bioquímica, biología molecular, genética y genómica

506.1.#.a: La titularidad de los derechos patrimoniales de este recurso digital pertenece a la Universidad Nacional Autónoma de México. Su uso se rige por una licencia Creative Commons BY 4.0 Internacional, https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.es, fecha de asignación de la licencia 2011, para un uso diferente consultar al responsable jurídico del repositorio por medio de contacto@dgru.unam.mx

041.#.7.h: spa

500.#.#.a: Una tendencia generalizada dentro de las ciencias biológicas del siglo pasado ha sido el estudiar a los componentes celulares y sus funciones de manera independiente, dentro de un esquema que pudiera llamarse "reduccionista". Basado en dicho enfoque se ha podido generar conocimiento significativo dentro de cada una de las ramas de la Biología y se espera que el impacto de nuevas tecnologías permita que el reservorio informativo crezca aun con mayor velocidad bajo este enfoque. Claros ejemplos de ello se encuentran en la Genómica y en la secuenciación de organismos, o bien en la cuantificación masiva de los transcritos del organismo bajo condiciones específicas de crecimiento. ¿Qué conocimiento puede ser generado en base a esta información? ¿Podemos avanzar a una nueva etapa que integre las relaciones existentes entre los diferentes componentes del genoma y su estructura de tal manera que comprendamos que el DNA genómico no sólo codifica proteínas y moléculas de RNA, o es el blanco estático de proteínas reguladoras, sino que sus propiedades estructurales pueden jugar un papel clave en la regulación de la expresión genética? En este sentido, nuestro proyecto de investigación plantea la caracterización de la Curvatura Estática del DNA y la Energía de Desnaturalización de su doble hebra, como dos propiedades estructurales de los genomas que tienen un papel relevante en la regulación transcripcional de organismos bacterianos._x000D_ _x000D_ En una primera etapa nuestro proyecto plantea, mediante algoritmos computacionales de análisis, identificar aquellas regiones río arriba de unidades transcripcionales en los más de mil genomas secuenciados y en los más de cincuenta metagenomas cuya secuencia se encuentra disponible públicamente y que contengan valores estadísticamente significativos en términos de su Curvatura Estática y de su Energía de desnaturalización. Cabe mencionar que para lograr este objetivo con la mayor precisión posible, no solamente planteamos el uso de algoritmos computacionales desarrollados por otros grupos o por nosotros mismos en períodos pasados, si no que contemplamos la optimización y desarrollo de nuevos programas de análisis._x000D_ _x000D_ En una segunda etapa de nuestro proyecto, contemplamos corroborar experimentalmente algunas de nuestras predicciones in silico que consideremos como las más importantes. Para realizar dicha caracterización realizaremos estudios in vitro (caracterización de movilidad de fragmentos curvos en campos electroforéticos, mutaciones sitio específicas para abatir el grado de Curvatura Estática o la Energía de desnaturalización en regiones específicas de DNA, etc.,) e in vivo (fusiones transcripcionales a genes reporteros, cuantificación específica de mRNA mediante técnicas de RT-PCR, etc.,) tanto en organismos modelo (Escherichia coli, Bacillus subtilis), como en organismos que hayamos identificados como relevantes en términos de su contenido de regiones Curvas de DNA o que contengan una alta frecuencia de regiones de baja Energía de Desnaturalización dentro de regiones de regulación._x000D_ _x000D_ Una tercera y última etapa contemplará la integración de la información de las etapas anteriores para la realización de nuevos modelos de regulación que contemplen a las propiedades estructurales antes mencionadas, dentro de la red de regulación de los genomas bacterianos. _x000D_

046.#.#.j: 2019-11-14 12:26:40.706

264.#.1.b: Dirección General de Asuntos del Personal Académico

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harvesting_date: 2019-11-14 12:26:40.706

856.#.0.q: text/html

last_modified: 2019-11-22 00:00:00

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No entro en nada

No entro en nada 2